1944 年末捷克斯洛伐克境内德军基地的 Me 410B-2/R2
由于身为用于本土防空作战的驱逐机，向 Me 410 项目划拨的原料行动奉命终止。福瓦尔德将军在 1943 年 10 月 26 日的备忘录中记录了戈林命令造成的混乱和浪费：加快高速轰炸机的生产步伐意味着为战斗机生产的座舱罩全部作废，因为轰炸机和驱逐机的座舱设计完全不同。在福瓦尔德看来，把轰炸机改装为驱逐机没有多大困难，只需加装一具 MG151A 机炮吊舱即可，整个工作只需花费一天。按照戈林的新计划，大部分飞机供应侦察机和轰炸机部队，每月交付驱逐机大队的飞机超不过 10 架。
此外，德国空军此时已经注意力从 Me 410 转到 Me 262 身上。希特勒、戈林及米尔希对喷气战斗机计划的一再延迟感到十分恼火。戈林在 1943 年 10 月 28 日命令法庭就 Me 262 延误一事对梅塞施米特展开调查。梅塞施米特则以他的一贯作风，把责任推倒劳动力不足上，但米尔希却疑心真正的原因是梅塞施米特将过多的精力花在 Me 209 的研制上。Me 209 早已被加兰德、米尔希和现在的戈林否决，米尔希怀疑梅塞施米特绕过他们，直接获得了希特勒的批准，继续把时间和资源浪费在一只“跛脚鸭”上。
6./ZG26 的 4 架 Me 410B-2/U4 编队起飞实施紧急截击任务
虽然受到这些烦心事的影响，Me 410 的发展和测试仍继续进行。5 厘米口径 BK5 机炮的实战效果没能达到加兰德的预期，其射速如果能够达到 60 发/分钟，在 1,000 米距离上开火，机炮所携带的全部 20 发炮弹最多能命中 2 发。MK103 足以击落敌军轰炸机，因而更受加兰德的青睐。BK5 机炮只有一个装弹机，使用中存在卡壳的隐患，这一问题在测试和实战中得到了证实。但有证据显示，这一问题出现于 1 月，一个月后便得到解决，武器工作恢复正常。不过，实战测试表明，装备 5 厘米机炮的 Me 410 一旦遭遇敌方护航战斗机拦截，便会因飞行品质恶劣而难以全身而退。只有射术高超的飞行员才能用 5 厘米机炮在规定距离上击落敌机。
梅塞施米特 Me 210/Me 410“大黄蜂”驱逐机发展史 侠影之谜 Part16
Me 410V24 在 1943 年测试了 3.7 厘米口径的 Flak 18C 机炮，但结果令人沮丧，原因是该炮只能携带 12 发炮弹。另有 2 架 Me 410 实验了更为现代化的 Flak 43，它用弹链供弹，但测试表明它的作战效能逊于两门 MK103，于是装 Flak 43 的 Me 410 改型在 1944 年年中被取消。
1943 年 10 月 8 日，2./ZG26 的 Me 410B-1/U2/R4 对抗第 8 空军的空袭
西格弗里德•科奈迈尔（Siegfried Knemeyer）在 1943 年年末明确指出了当时德国战斗机生产现状。科奈迈尔是德国空军的一位技术天才，同时也是一位发明家，他在二战前担任航空工程师，从事仪表飞行研究。战争爆发后，科奈迈尔加入德国空军，起先担任冯•布劳希奇（Von Brauchitsch）将军的私人飞行员，随后进入侦察机部队服役，曾驾驶过 Ju 88 和 Ar 240。之后科奈迈尔被任命为——技术办公室主管，还曾短时间里担任戈林的助手，正是在此期间，他设法说服戈林授予 Me 262 发展优先权。1943 年 11 月，他成为米尔希手下的主管，1944 年元旦前夕，科奈迈尔的介入成为决定 Me 410 未来发展前途的转折点，他坚决要求将单发战斗机的发展和生产放到首位，并极力强调 Me 262 的重要性。他清楚的知道，无论是作为高速轰炸机还是驱逐机，Me 410 都难以胜任。但经过一定的改进，Me 410 仍能在德国的本土防空作战中发挥应有的作用，但前提是必须为飞机加装专用的机载设备和斜射炮。Me 410 的大哥，配备 DB605 发动机的 Bf 110 的速度过于缓慢。
KG 51 的 Me 410 双机编队
科奈迈尔更加重视 Fw 190D 这类装 2,000 马力发动机的单发战斗机以及喷气战机。很显然，如果当初没有在 Me 210 投入过大资源的话，也不会出现日后的 Me 410。科奈迈尔对梅塞施米特的个人印象不佳——一个不可靠的人。
重量更轻的 Me 410 高空战斗型于 1943 年 11 月开始研制，雷希林和第 25 试飞特遣队各装配了一架原型机，它们装有 GM-1 系统、3.7 厘米机炮（Flak 43）及 ZFR 套筒式瞄准镜，实用升限 10,000 米。
但高空型只得到了加兰德一人的支持，希特勒和戈林仍一门心思想着轰炸英国，只答应每月生产 10~15 架 Me 410 驱逐机。讽刺的是，轰炸机总监宁愿用 Ju 88S 来取代 Me 410。德军高层当时只有加兰德一人支持生产 Me 410 的驱逐机型，而道尼尔设在慕尼黑的工厂这时已开始生产 Me 410 的轰炸机型。
随着 1943 年临近尾声，Me 410 的发展前景也变得越来越不乐观。加兰德支持把 Me 410 发展成轰炸机驱逐机。他坚持认为，具有重武装的飞机能够驱散敌军轰炸机编队，方便单发战斗机将落单的敌机逐个击破。加兰德希望每月至少生产 100 至 150 架配备 MK103 机炮和 GM-1 喷射系统的 Me 410。在 1943 年 11 月 29 日的一次成功战斗中，一架 Me 410 以两秒的间隔向一队盟军轰炸机发射火箭，迫使 10 架轰炸机脱离编队。在另外一次战斗中，一队 13 架飞机的编队的 12 架飞机被击落。但这些战果几乎没有对德国空军高层的长期规划产生任何影响。从第 25 测试特遣队 1943 年 11 月的一份试飞报告看，米尔希显然认为如果 Do 335 易于维护保养，就没必要继续生产 Me 410 这类飞机，道尼尔慕尼黑工厂完成一定数量的 Me 410 后，应立即转产 Do 335。
1945 年被苏军俘获后公开展出的 Me 410
米尔希对 Me 410 的态度十分矛盾。他一方面认为该机是在经过了艰苦的开发过程后，才摆脱了夭折的命运。但从技术角度看，Me 410 是没有发展前途的。但他另一方面又承认 Me 410 不失为一种优秀的昼间重型战斗机。梅塞施米特甚至提出了在 1945 年第三季度为 Me 410 更换木质机翼的计划，以应对铝材匮乏的局面。希特勒对装 5 厘米机炮的 Me 410 相当迷恋。加兰德希望这种飞机即使不能装备一个联队，至少也应该有一个大队的规模。加兰德认为，装 5厘米机炮的 Me 410 性能尚可，但实战的运用却很难令人满意。依照他的观点，Me 410 显得不够结实，致使他手下部队中的 80 架 Me 410 报废。除此之外，Me 410 还有 30 架毁于训练。30 架在起降时失事，被敌军击落的只有 20 架。还有报告称，在英国上空作战时，曾有敌机以 620 公里/小时的速度逼近 Me 410，但未能得手。总体而言，Me 410 对战局的影响微不足道，它需要花费很大气力才能把一枚 500 公斤炸弹投向目标。这些佩尔茨所不需要的飞机却是加兰德所急需的，加兰德最终设法说服了戈林按他的意愿来分配 Me 410。