“阶段 I 升级”虽然是基于海鹞 FRS.1 的改进，但这些改进实际上奠定了海鹞 FRS.2 的基础。1983 年，“阶段 II 升级”计划启动，并于 1985 年与 BAE（英国航宇，1977 年由包括霍克在内的几家公司联合组建）签署合同，授权该公司对部分现役经过阶段 I 升级的海鹞 FRS.1 再度改进，并以此为标准重新生产一批海鹞，这一批经过改进以及重新生产的飞机被命名为海鹞 FRS.2——也是最后一种纯英国血统的战斗机。
海鹞 FRS.2 最大的改进是换装了“蓝雌狐”全天候 PD 火控雷达，并具备了使用 AIM-120 先进中距空空导弹的能力。和“蓝狐”雷达相比，“蓝雌狐”雷达要先进得多：它有 11 种操作模式；具有更远的探测距离；具备边跟踪边搜索和多目标攻击能力，可以在跟踪目标的同时搜索其它目标；增加了“下视”能力；具有一定程度上的防截获能力，减小触发目标雷达告警接收机的概率。“蓝雌狐”雷达的智能化程度比较高，使用方便，海鹞飞行员对此是比较满意的。一个飞行员曾说过，如果要执行拦截任务，只需选择“空对空”模式，然后让飞机飞向大致方向，然后一切就交给雷达好了。AIM-120 射程远，速度快，具备“发射后不管”能力。它与“蓝雌狐”结合，使得海鹞首次具备了超视距空战的能力，这在一定程度上弥补了该机拦截能力的不足。海鹞 FRS.2 可以在每个机翼外侧挂架各挂载 1 枚 AIM-120，在机身腹部两侧原航炮吊舱位置挂载 2 枚 AIM-120，共计 4 枚。当然，也可以在外侧挂架换装 4 枚 AIM-9“响尾蛇”导弹，构成“4+2”的挂载方案。
为了容纳新的雷达和航电设备，海鹞 FRS.2 加长了 35㎝。最初曾经考虑加长机翼翼尖，以改善飞机气动性能，弥补加装 AIM-120 带来的性能下降，但后来发现这样改进意义不大，也就取消了。不过 BAE 仍对该机机翼进行了小范围的改进。该机的发动机也改为在飞马 11 Mk.104 基础上改进、综合性能更好的飞马 11 Mk.106。
为了更好地改进人机工效，提高作战效率，海鹞 FRS.2 的座舱再次进行了大幅度改进，增加了多功能下视显示器，并引入了“双杆操纵（HOTAS）”概念。原导航/攻击系统进行了改进，此外还加装了马可尼的“天空卫兵”雷达告警接收机（与 AV-8S 所装的基本相同）。值得一提的是，海鹞 FRS.2 还采用了军标 1553B 数据总线，对日后航电升级和改进非常有利。在原设计中，该机还将装备 GPS 导航定位系统，但拖延了很长时间。在此之前，皇家海军只好因陋就简，利用手持式 Garmin 100GPS 接收机进行定位。
1988 年，由海鹞 FRS.1 改进而来的两架海鹞 FRS.2 原型机（ZA195，XZ439）相继试飞。从 1995 年至 1998 年，BAE 交付了 18 架全新的鹞 FRS.2（ZH796-813），加上在此之前改装的 33 架海鹞 FRS.1（一说 29 架），英国皇家海军此时共拥有 51 架现代化的海鹞 FRS.2。而未经改装的海鹞 FRS.1 已全部退役。
90 年代中期，海鹞 FRS.1 更名为海鹞F/A.2，意为“战斗/攻击”。而原来设计的侦察任务则被放弃——因为海鹞本身并不适合执行此类任务，而皇家海军也从未试图为该机加装侦察吊舱。有意思的是原来代表“攻击”的“S（Strike）”换成了“A（Attack）”。因为对于英国军队来说，原来的 S 是代表“核打击”，而随着西方削减战术核力量的潮流，海鹞也在 1991 年取消了核打击任务，所以不再使用“S”缩写。1 年后，海鹞 F/A.2 再度更名为海鹞 FA.2。这次改名的理由有点让人啼笑皆非——因为那个“/”使得原来的名称看起来非常象美国飞机的编号，这多少伤了约翰牛的自尊心，特别是对于这最后一种纯英国血统的战斗机而言更是如此。
同样，海鹞 FA.2 也有教练型，即鹞 T.8N。该机实际上是由鹞 T.4/T.4N 改装而来，发动机改为飞马 11 Mk.106，航电和座舱布局参照海鹞 FA.2 的标准进行了改进，但没有装备“蓝雌狐”雷达。该机 1994 年首次试飞，至 1996 年一共交付了 5 架（ZB603-605，ZD992-993）。
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背景
第二代鹞式飞机研制起步非常早，甚至可以追溯到海鹞问世之前。霍克急于推出新一代鹞式飞机的根本原因还是在于军方对鹞的性能不满意。缺乏超音速性能是不用说了，自 P.1127 以来这始终是军方的一块心病，否则也不会有倒霉的 P.1154 项目了。而鹞式飞机可怜的载荷－航程能力也令军方深为不满，远不如同时期的“美洲虎”攻击机。当初要不是因为鹞是唯一的国产飞机，早就被“美洲虎”挤下去了。
在这种背景下，霍克于 1973 年与麦•道签署协议，联合进行新一代鹞式飞机的概念研究，这种飞机比鹞更大、性能更好，同时具有超音速飞行能力。后来该方案被称作 AV-16A 或者 AV-8X——第一个名称很容易让人想起F-16改攻击机方案（A-16），当然实际上没啥联系，它的真正含义是：载弹量和航程均为 AV-8 的两倍，即 AV-（8×2）。已经服役的鹞式飞机证明了它自身的实用性，如果这一性能改进能够实现，那么可以预计订单将会源源而来。但作为 AV-8X 性能提升的关键，飞马 15 发动机的研制却并非一帆风顺。由于在政府资助的飞马 15 研制费用分担比例方面出现问题，英国政府于 1975 年退出了该项目。霍克与麦•道的联合发展计划也因此而完全终止。