日皇投降广播后，B-29 的所有轰炸都停止了。太平洋战区的大部份 B-29 转而执行救援任务，为在日本、中国、朝鲜境内的数以万计的盟军战俘空投衣食，1,066 架 B-29 执行了 900 次空投任务，154 个集中营约 63,500 名战俘获得了 4,470 吨救援物资。但在拯救行动中也损失了 8 架 B-29 和 77 名人员。
9 月 2 日，日本在东京湾密苏里号战列舰上签字投降，太平洋战争结束。
“伊诺拉.盖伊”号退役后，被赠送给史密森学会（唯一由美国政府资助的半官方性质的博物馆机构），多年后，它被拆解储存在史密森学会位于马里兰州苏特兰市的保罗.盖博（Paul Garber）修复储存基地中。为了纪念原子弹轰炸广岛 50 周年，1995 年 6 月 28 日，“伊诺拉.盖伊”号的前机身和一些部件在华盛顿国家航空航天博物馆展出，98 年展出结束后返回仓库。在是否重新修复组装“伊诺拉.盖伊”号的问题上仍然存在政治来自日本的政治压力。
中新网 8 月 19 日电 据路透社消息，曾经于二战期间向日本广岛投下原子弹的美军 B-29 型“埃诺拉·盖伊”号（ENOLA GAY）轰炸机将在史密森航空航天博物馆展出。
史密森航空航天博物馆星期一（18 日）在杜勒斯国际机场附近一个展览中心的巨大机库中揭开了这架修复一新的 B-29 轰炸机的面纱。
博物馆馆长戴利说：“由于一些天才男女的杰出工作，未来的人们才能够亲身感受这架二战飞机无可比拟的重要性，才能亲身感受人类历史。希望我们能从它身上学到什么。”
“埃诺拉·盖伊”号于 1945 年 8 月 6 日向日本广岛市投下了一颗绰号为“小男孩”的原子弹，造成14万多人死亡，几十万人受到幅射病的折磨。如果加上因幅射病死亡的人，那么“小男孩”杀死的人数高达 23 万。
1945 年 8 月 6 日这天的上午 8:15，美军飞行员保罗·蒂贝茨驾驶机身上写有自己母亲名字“埃诺拉·盖伊”的轰炸机飞到广岛上面 9,632 米的高空，向这个城市投下了原子弹。几十秒钟后当原子弹接地的一刹那，广岛变成一片人间地狱。8 月 9 日，“埃诺拉·盖伊”号再次出动，不过此次它负责为执行长崎轰炸任务的飞机勘测天气状况。在长崎投下的原子弹杀死了7万人。
一些日裔美国人称，他们希望展方能够将原子弹爆炸的可怕破坏场面也同时展示出来。一名日裔历史学家说：“我并不反对重新组装起‘埃诺拉·盖伊’号，但如果人们看不到这架飞机背后的故事，那么大家纯粹是在浪费时间。我们必须提醒自己核武器是多么可怕。”
曾装载“小男孩”的弹舱
“伯克之车”退役后一直在俄亥俄州代顿市莱特-帕特森空军基地的美国空军博物馆展出。
美国空军博物馆的“伯克之车”号
Armstrong Part8
纪念对日作战胜利 58 周年
1945 年 9 月对日作战胜利后，陆军航空军撤销了战时签订的多达 5,092 架的 B-29 订单。但这并不意味着 B-29 的停产，陆军航空军允许 B-29 以低速继续生产，到 1946 年停产时为止，美国各飞机厂共生产了 3,970 架 B-29。
二战结束时，由于具有突出的战略价值，大量剩余的 B-29 被封存起来，并不像 B-17 和 B-25 那样流入民间市场。继续飞行的 B-29 则进入了新成立的美国空军服役，到 1947 年，由于军备的急剧削减，美国战略空军司令部仅拥有 6 个 B-29 大队，其中只有 509 大队具有核轰炸能力。
1950 年，B-29 被重新定位成“中型”轰炸机，远程战略轰炸任务移交给了 B-36 和 B-50。此时美国空军装备有 1,787 架 B-29 和 162 架 RB-29 侦察机，除了用于装备 8 个轰炸机大队和一个战略侦察大队外，其余的都被封存。
但很快 B-29 又一次投入作战。1950 年 6 月 25 日朝鲜战争爆发，6 月 27 日，美国操纵联合国通过武力干涉朝鲜内战提案。杜鲁门总统授命日本占领军司令道格拉斯.麦克阿瑟将军武力入侵朝鲜。麦克阿瑟责成远东空军司令乔治.E. 斯特拉特迈耶将军对南朝鲜军前线和三八线之间的朝鲜军队进行轰炸。此时只有驻关岛安德森机场的第 19 轰炸机大队的 22 架 B-29 能够执行次任务，所以这个单位被调往冲绳嘉手纳空军基地。6 月 28 日，B-29 开始轰炸朝鲜目标，6 月 29 日 B-29 轰炸了朝鲜境内的机场，B-29 甚至还用于执行诸如轰炸行军中的朝鲜部队之类的战术任务。
7 月 8 日，远东空军成立了一个特别的轰炸机司令部用于统一指挥朝鲜战场的 B-29，埃米特.奥道尼尔将军担任指挥官。7 月 13 日，轰炸机司令部正式接管了第 19 大队，第 22 大队和从战略空军借来的第 92 大队的指挥权。7 月下旬，麦克阿瑟将军同意 B-29 轰炸三八线附近的军事目标，试图以此切断进入南朝鲜境内的朝鲜部队的补给线。
7 月末，第 98 和第 307 轰炸机大队飞抵日本，加入远东空军，后又有第 31 战略侦察大队加入。第 92、98 大队和第 31 侦察大队的基地设在日本，第 19、22 和第 307 大队的基地设在冲绳。
冲绳嘉手纳基地的 B-29
B-29 早期执行的任务都是诸如轰炸坦克集群、部队、运输车队、武器库和补给站之类的战术目标，B-29 不适于执行此类任务，并常遭遇小口径高炮和战斗机的攻击，未取得多大战果。8 月 4 日，B-29 被准许轰炸朝鲜境内的战略目标，8 月 4 日到 10 日间，B-29 轰炸了朝鲜境内的一个铁路调度站，试图扰乱朝鲜军队的铁路补给线，但未达到目的；47 架 B-29 轰炸了兴南的朝鲜炸药厂，另外 39 架 B-29 轰炸了兴南的卫生化工厂。8 月 12 到 20 日，B-29 对朝鲜的战略公路和铁路桥梁进行了一系列的轰炸，第 22 和第 92 队的 B-29 只能挂载单枚重量 227 千克的炸弹，对结构坚固的桥梁来说威力不足；第 19 大队的 B-29 能够挂载 907 千克的炸弹，但即使使用 907 千克的大炸弹，一座典型的桥梁也必需要进行持续几天的轰炸才能被彻底摧毁。到 8 月底，44 座桥梁中的 37 座已经倒塌，剩余的七座也已不堪使用。