与其他二战飞机不同，B-29 没有出现在战后倾销剩余物资的市场中，以后也没有卖到民间，这是幸存到现在的 B-29 数量稀少的主要原因。
1970 年代，在美国海军加州中国湖靶场发现了存放着一批完整无缺的 B-29。其中的两架通过使用此地其他 B-29 的零件恢复成可飞状态。B-29A 44-62070 被德克萨斯州哈林根市的民间组织同盟空军获得，民间注册号 N529B，绰号“FiFi”。B-29 44-61748 被捐赠给位于英国杜克斯福德的帝国战争博物馆，1980 这架 B-29 横跨大西洋飞到英国，英国注册号 G-BHDK。现在帝国战争博物馆的美国航空分馆。B-29 44-62022 露天停放在中国湖海军武器中心多年后被科罗拉多州普艾布市韦尔斯布罗德航空博物馆获得，现在正在修复中。此地的其他 B-29 解体后运往各个私人和空军基地的博物馆，组装后展出。其中一架在卡瑟航空博物馆展出的 B-29A 实际上是由三架 B-29 的部件拼装成的，主要的部件来自 44-70064。这架飞机的涂装改成了朝鲜战争时期以冲绳为基地的第 19 轰炸机大队第 28 中队式样。
2001 休斯敦之翼航空展上的“FiFi”
B-29 44-69972 与许多其它 B-29 于战后封存在德克萨斯州派特陆军航空基地。朝鲜战争时期，44-69972 解封并投入作战，后来又被改装成雷达校准机一直使用到 1955 年。1956 年被送往中国湖的美国海军武器中心作为弹道导弹的靶子，一放就是许多年。现在这架飞机被加州的美国航空博物馆（西部分馆）获得，并正在由波音公司修复成可飞的状态。
除了中国湖“出土”的一批 B-29 外，还有一些珍稀的 B-29 散布在各个航空博物馆。B-29A 44-61669 现在的民间注册号是 N3299F，在马赤空军基地博物馆展出。B-29-25-MO 42-65281 在特拉维斯空军基地展出；B-29A 44-62220 在德克萨斯州凯利空军基地露天展出；B-29B 44-84053 在佐治亚州华纳.罗宾斯空军基地的航空博物馆展出；B-29-55-MO 44-86408 在犹他州希尔空军基地博物馆；B-29A 44-87627 在路易斯安那州巴卡戴尔空军基地的第8航空军博物馆；B-29-90-BW 44-87779 在南达科塔州的埃尔斯沃斯空军基地博物馆。
B-29 45-21739 被美国政府赠与韩国政府，在汉城朝鲜战争联合国军博物馆展出。两架原子弹轰炸机都得到了很好的照顾，轰炸广岛的“伊诺拉.盖伊”号储存在保罗.盖博修复储存基地中，轰炸长崎的“伯克之车”号在莱特-帕特森空军基地展出。
B-29A 44-61975 在康涅狄格州新英格兰航空博物馆展出。这架飞机制造于 1945 年，曾数个基地担任过训练任务。1954 随后恢复成轰炸机配置后进驻英国墨尔斯沃斯基地两年。后来与其它 B-29 一起被送到马里兰州亚伯丁靶场。1973 年被新英格兰航空博物馆获得，拆解后运往布雷德利机场重新组装。1979 年 10 月 3 日，一场龙卷风破坏了博物馆户外展出的大部分飞机包括这架 B-29。至今仍处于修复状态，使用了来自亚伯丁其他 B-29 的部件。
西雅图市飞行博物馆展出着一架 B-29，表面上这架飞机是威奇塔制造的 B-29-60-BW “丁字尺”号，序列号 44-69729，但实际上是由三架 B-29 的部件拼凑而成。在历史上真正的 44-69729 隶属于驻马里亚纳的第 498 轰炸机大队第 875 中队，完成了三十七次轰炸任务，1949 年 6 月改装为 KB-29 加油机。
B-29A 44-70016 在亚历桑那州图森市皮玛县的皮玛博物馆展出，原先是驻关岛第 20 航空军第 330 大队的飞机。B-29 44-70113 是第 20 航空军第 73 联队的飞机，参加轰炸日本。1956 年退役后封存，1994 年经过修复，现在佐治亚州多宾斯空军基地展出。
皮玛航空博物馆的 B-29A 44-70016
KB-29P 44-83905 在 1956 年阿拉斯加州艾尔森空军基地的一次着陆事故中损坏，机组没有受伤，但当在试图把飞机拖离跑道时，严重损伤了飞机。在拆除了昂贵的部件后，这架飞机被遗弃在航线附近多年，后来在 1960 年代早期进行的基地清理工作中将其拖到一个沙坑中，现在沙坑已经形成了一个小湖，而 B-29 被遗忘在其中。
阿拉斯加州艾尔森空军基地的“湖中女皇”
TB-29 44-84076 由于交付太晚没有赶上二战。1947-1952 年间，在战略空军服役，后被用于雷达校正。1955 年运往内布拉斯加州奥福特空军基地战略空军博物展出。B-29 45-21748 在查纽特空军基地展出了很长时间，飞机经过重新涂装，尾码改成了 45-01749。1993 年查纽特空军基地关闭后，移到 Sandia 国家核子博物馆展出。
B-29 的故事现在告一段落了，除了“FiFi”外，其余的 B-29 都要在博物馆中度过余生。由于存世的稀少和传奇的经历，超级空中堡垒一直都是航空迷的视线焦点。在 B-29 之后，恐怕没有任何一种飞机能与其相提并论，因为 B-29 曾摧毁过一个国家……
二战时期，陆军航空队训练转换学校的一架 B-29 飞行在阿拉巴马河上空