1943 年春天，飞鹰再度前往南洋进行对拉包尔等岛进行战机的运输工作，这是由于当时日本海军的舰上航空兵力尚未训练完成，因此部份航空母舰上的舰载机转往陆基使用，并担任起运送陆基航空队战机的任务。不过在 1943 年 6 月 10 日，飞鹰载运战机再次前往南洋时，在东京湾的三宅岛附近遭到了美国潜艇攻击，1 枚鱼雷击中飞鹰的舰首后部，前部炉舱因为鱼雷的攻击引起严重的损坏和进水，飞鹰随即因此失去了动力在海上漂流，所幸事发地点距离日本本土很近，在日本海军工作队的抢救下，飞鹰折回横须贺进行修复。
在经过了短暂的修复后，飞鹰在 1943 年秋天开始又连续前往帕劳、菲律宾、新加坡、特鲁克等地进行战机的运输工作，并暂时充当护卫空母使用。一直到 1944 年 5 月，飞鹰的航空部队才正式训练完毕，并且换装了天山、彗星和零战五二型等新式舰上战机，随后转往南洋以加强内防御圈的战力。
1944 年 6 月，美国机动部队进攻塞班岛，日本发动阿号作战，双方爆发马里亚纳海战。19 日当天天气极不理想，海面上乌云密布。此时由于战争的消耗，训练有素的精锐飞行员已经所剩无几，很多的飞行员都还是刚刚从飞行学校毕业的菜鸟。这些技术不够熟练的飞行员在经过 400 海浬的长距离飞行后，大部份都发生了迷航的状况，而且就算到达舰队上方也无从辨识目标投弹。反观美军舰队有良好的通讯和雷达预警系统，能够紧急调派战机前往 100 海浬处紧急拦截日机，加上对空搜索雷达和 VT 信管的发威下，美军在该战中一共击落超过 300 架的日本战机，因而有"马里亚纳射火鸡" 这一说法的诞生。
飞鹰在作战中遭到美军“列克星顿”号（CV-16）航母的舰载机打击，被命中一条鱼雷和一枚航弹，引起大火。晚上 7 时，由于大火引发舰上油气爆炸，于 6 月 20 日沉没在塞班岛西方海域。
该舰主要性能数据为：（沉没时）
排水量：24,240 吨（基准） 长×宽×吃水：219.32m×26.7m×8.15m 飞行甲板尺寸（长×宽）：210.3m×27.3m 动力：川崎拉蒙特式锅炉 6 座，蒸汽轮机 2 台，双轴推进 56,250hp 航速：25.5 节 续航力：12，251 海里/18 节（重油 4,100 吨） 火力：40 倍口径 127 毫米双联装高炮 6 座；25 毫米三联装机关炮 8 座，120 毫米 28 联装防空火箭 6 座。 舰载机：舰战 12+3 架，舰爆 18+2 架，舰攻 18+5 架，备用机 5 架 舰员：1,330 人 重本站权利，转载本站文章请注明出处。您如果看到不注明转载的情况，方便的话请当场指出。空军之翼将十分感谢您的热心帮助！
隼鹰号（Junyo）
“隼鹰号”是由“橿原丸号”高速邮轮改装而成。橿原丸是橿原丸型客轮的一号船，拥有姊妹船出云丸。不过由于日美关系紧张，橿原丸在 1940 年 10 月决定改装成空母，改装作业在 1942 年 5 月 3 日于三菱长崎造船厂完工。不过在完工时仍然采用了橿原丸的名字，并和空母龙骧共同编组第四航空战队。在中途岛海战时由于橿原丸的飞行队经验较为不足，因此第四航空战队随充当诱饵的北方舰队出击，由于当地的美军势力并不强，第四航空战队游刃有余，除了占领了阿留申群岛的基思卡岛等地，甚至还轰炸了阿拉斯加西岸的荷兰港。一直到出云丸完工并改名飞鹰后，橿原丸才改名为隼鹰。由于隼鹰比较早完工，也有很多人称其为隼鹰级，不过这里以飞鹰的舰名较早出现而称其为飞鹰级。
在瓜岛附近的圣塔克鲁兹海战（日本称为南太平洋海战）中，日军在作头两轮攻击时，企业号首先侦测到敌机并躲入雷雨云中，而暴露在洋上的大黄蜂号则遭到日军的集中攻击。先后一共有 5 枚重型炸弹和2枚鱼雷击中舰身，其中两架日机还对其做出了自杀性攻击，造成舰上动力中断并引发大火，随即陷入无法挽救的状况，最后被日军驱逐舰发射鱼雷击沉。而企业号则在日军的第三次攻击时，以 28 节的超高航速连续急转舵作出闪避动作，舰身当时倾斜高达 30 度以上，飞行甲板上的飞机还因此掉入了海中，不过也因此连续躲过 9 枚来袭的鱼雷。
隼鹰在该战中也收容了不少来自受损的翔鹤、瑞凤两舰的战机，并且成功的轰炸企业号、战舰南达科塔号和轻巡洋舰圣裘安号，导致三舰受创，并给了空母大黄蜂号最后的致命攻击。不过在该战中由于美军的阻挠，因此未能对瓜岛做出有效的补给，至此双方机动部队退出了瓜岛水域进行整补，瓜岛的制空权完全落入了美军的手中，因此该战中虽然日本取得了战术性胜利，但却让美军赢得了战略性胜利。
1943 年 2 月，隼鹰退出特鲁克回到吴港并进行了改装，加装了对空搜索用的二一号和一三号电探。由于隼鹰在之前战役中损失的战机没有补齐，飞行员也还在训练中，因此改为出任运输任务，不过在 1943 年 11 月时在丰后水道南端遭美军潜艇攻击，舰尾严重受创，飞行甲板后段整个被毁并失去航行能力，最后由重型巡洋舰“利根号”进行带缆拖曳回到佐世保进行修复。
在马里亚纳海战中，飞鹰惨遭炸沉；隼鹰则被美机的 2 枚炸弹击中烟囱，烟囱断裂并且导致舰桥附近受到了不小的伤害，失去了起降战机的能力，不过并没有对航行造成问题。
马里亚纳海战之后，隼鹰号和其他残存的舰只都大幅度加强了对空炮火和避沉损管的能力，但因为一直无法装载到足够的战机，一直没有出击的机会而转而进行运输的任务。
在 1944 年 12 月执行向台湾运输的任务归途中，于长崎的母野半岛（今长崎半岛）外海遭美国潜艇“蝠鲼鱼号”（Sea DevilSS/AGSS-400）和“雄鲑号”（Redfish SS/AGSS-395）的鱼雷攻击，两枚鱼雷分别击中了右舷的机舱及舰艏，造成隼鹰号上面 19 人阵亡，进水 5,000 吨，仅靠着左舷侧的主机推进低速回到了佐世保。
之后隼鹰一直在佐世保进行修复，直到 1945 年 3 月战局进入最后阶段为止。由于当时日本已经没有能力再让隼鹰出击了，隼鹰只有系泊在佐世保附近的惠美湾，就这样一直到战争结束，不过受创的右舷侧轮机一直都没有修复。隼鹰在战后担任复员任务的特设运输舰，协助运送人员和物资，复原任务结束后于 1947 年在佐世保解体。
该舰主要性能数据为：（最后改装时）