今天只有几架 B-17E 幸存下来，其中之一是 41-2595。这架飞机在 1944 年被改成运输机，型号改为 XC-108A。战后这架飞机被拖到缅因州道尔（Dow）机场废物堆积场拆解遗弃多年。1985 年，一个古董飞机迷发现了 41-2595 的部件和残片并运到伊利诺伊州高尔特（Galt）航空站准备进行组装和修复。
上：41-2595 B-17E 状态，下：41-2595 XC-108A 状态
1985 年残片被发现，Source:http://usaaf.com
另一架 B-17E 是 41-2446“沼泽幽灵”，这架飞机在 1942 年 2 月迫降在沼泽之中而被遗弃于巴布亚新几内亚（Papua New Guinea）。实际上损坏不严重，一些美国机构已经试图将其捞出修复。
41-2446 的结构保存还相当完整
B-17E 41-9101 和 41-9105 在 1942 年 7 月由 6 架 P-38F 护送从格陵兰跨越大西洋飞向英国时遇到恶劣的气候，所有飞机都不得不在格陵兰偏远冰盖上迫降。机组人员全部被援救，但飞机必须被抛弃。1987 年查明这些飞机埋在雪层下 79 米，人们后来挖出一架 P-38F 修复后重返蓝天。
B-17E 41-9210 在战争期间被当作测试机使用，战后被作为剩余物资流入民间市场。经过在美国和加拿大几次转手，最后进入玻利维亚航空公司作为货机。1976 年这架飞机在一次起飞事故中损坏，就作为“器官捐献者”维持航空公司其余 B-17 的飞行。这架飞机被遗弃在拉巴斯（La Paz），1990 年被发现后运回美国进行修复，现成为唯一能飞的 B-17E。
41-9210 当作货机时期
修复后的 41-9210
B-17E 性能规格表
发动机：4 具赖特 R-1820-65“旋风”星型发动机，起飞功率 1,200 马力，高度 7,620 米时 1,000 马力。
性能：最大时速 512 公里（7,620 米），巡航时速 314-375 公里，着陆时速 113 公里。实用升限 11,156 米。初始爬升率 436 米/分，爬升至 1,424 米耗时 7 分。最大航程 3,218 公里（载弹 1,814 千克）/5,471 公里（空载）。
重量：空重 14,674 千克，正常起飞重量 18,262 千克，最大起飞重量 24,041 千克。
燃料：正常燃料容量 9,425 升，携带了额外油箱后总燃料容量 13,671 升。
尺寸：翼展 31.63 米，全长 22.49 米，全高 5.84 米，翼面积 131.92 平方米。
军械：一挺 7.62 毫米机枪，可安装于机身前部任一球形机枪座。机背一座斯佩里 Model 645473E 动力炮塔，内置两挺 12.7 毫米白朗宁机枪，每挺带弹 500 发。机腹一座斯佩里 Model 654849-J 动力炮塔，内置两挺 12.7 毫米白朗宁机枪，每挺带弹 500 发。腰部两侧 12.7 毫米白朗宁机枪各一挺，每挺带弹 400 发。尾部两挺 12.7 毫米白朗宁机枪，每挺带弹 500 发。内部弹舱最多可挂载 26 枚 45 千克（100 磅）炸弹，或 16 枚 136 千克（300 磅）炸弹，或 12 枚 227 千克（500 磅）炸弹，或 8 枚4 54 千克（1,000 磅）炸弹，或 4 枚 907 千克（2,000 磅）炸弹。
太平洋战场的 B-17
1941 年 12 月初珍珠港事件之前，USAAC 拥有 13 个重型轰炸机大队，但其中大部分轰炸机数量低于标准编制 32 架，并且许多大队还装备设计过时的道格拉斯 B-18。USAAC 手头的 B-17 只有 150 架，大部分是小垂尾的 B-17C/D，仅有很少的 B-17E。
由于战争阴云密布，大多数飞行堡垒都派驻海外。驻扎在巴拿马运河区（Canal Zone）的第 6 轰炸机大队已有 8 架 B-17B，在 1941 年 12 月初接收了 8 架崭新的 B-17E。驻扎在纽芬兰的第 42 侦察中队装备了 6 架 B-17B，驻扎在犹他州盐湖城（Salt Lake City）的第 7 轰炸机大队拥有满编制的 35 架新型 B-17E。部署在菲律宾的第 19 轰炸机大队有 6 架 B-17C 和 29 架 B-17D，第 19 大队的第 14 中队在 1941 年 9 月横跨太平洋飞抵菲律宾克拉克（Clark）机场，该大队的另外两个中队在 10 月飞抵菲律宾。部署在夏威夷希凯姆（Hickam）机场的第 5 轰炸机大队有 12 架 B-17D。USAAC 其余的重型轰炸机大队总共装备 12 架 YB-17、22 架 B-17B 和 5 架 B-17C。
USAAC 的 B-17 在不经意中卷入实战。12 月 7 日，第 38 侦察中队的 4 架 B-17C 和两架新型 B-17E 从加州汉密尔顿（Hamilton）机场起飞前往菲律宾，中途停靠在珍珠港，这些飞机没有武装。由于这次转场，使珍珠港的雷达员将日本进攻机群误认为 B-17，而没有报警。B-17 编队在第一攻击波结束时飞抵珍珠港，在混乱中一些飞机设法在哈雷瓦（Haleiwa）机场较短的战斗机跑道上强行着陆，一架迫降在高尔夫球场，其余的飞机冒着零式战斗机的扫射在希凯姆降落。第 5 轰炸机大队的 12 架 B-17D 露天停放在希凯姆机场，结果 5 架被击毁，8 架被击伤。
希凯姆机场被击毁的 B-17D
驻扎在盐湖城的第 7 轰炸机大队于 12 月 5 日奉命离开犹他州前往远东，先行的 6 架 B-17 在珍珠港刚刚被袭后抵达夏威夷，由于担心日本舰队随时可能出现在圣巴巴拉（Santa Barbara）附近海面，第 7 轰炸机大队其余的飞机被留在美国以防日本对加州的威胁。
混乱中在哈雷瓦机场着陆的 B-17C
珍珠港被袭的消息在 12 月 8 日大约早上 3 点传到了菲律宾。依照先前制定的方案，如果敌对行动爆发，第 19 轰炸机大队的飞行堡垒要即刻对在台湾的日本基地发动攻击。12 月 8 日，在菲律宾共有 35 架 B-17，其中吕宋岛（Luzon）的克拉克机场部署有两个中队共 19 架飞机，800 公里之外棉兰老岛（Mindanao）的德尔蒙特（Del Monte）机场部署着另外两个中队 16 架 B-17。