贝策小组冲锋的同时，后面吉普上的人也在迅速下车，向预定目标冲击。士兵阿莫斯应该跟着阿姆农上尉冲，但下车后在黑暗中没有看见阿姆农，以为自己落后了。阿莫斯记住了内塔尼亚胡在出发前的指令：时间就是生命，不顾一切尽快往前冲。于是他拔足飞奔，甚至绕过了贝策小组，直冲进大候机厅，看到前面地上匍匐着一个恐怖分子，立刻开枪击毙。在转头寻找队友配合的时候，才惊讶地发现，大厅里只有他一个突击队员！阿姆农实际上在阿莫斯背后，但阿莫斯跑得太快了，阿姆农只来得及在阿莫斯停下来查看的时候，才冲进了大候机厅，正好看到旁边匍匐着两个阿莫斯漏掉的恐怖分子，立刻开枪击毙。应该首先冲进大厅的贝策小组这时也冲了进来，另一个恐怖分子跳起来，正好被突击队乱枪击毙。至此营救行动实际上已经结束，离奔驰冲出一号机只有3分钟，离击毙乌干达哨兵只有1分钟。
以色列人使用AK47与乌干达士兵交战
不过战斗没有结束。另外一个小组冲进小候机厅，情报表明三天前人质曾经全部集中在小候机厅，但这时实际上人质已经集中到大候机厅，小候机厅和旁边的房间成为恐怖分子的休息室，三个恐怖分子自然在片刻间成为枪下鬼。另一个小组在往里扔手榴弹的时候，手榴弹从窗框上弹回来，炸伤了一个突击队员，但最后还是完成了任务。还有一队两个小组冲进大候机厅左侧的海关厅，但突击队在出发前对海关厅的布局一点没有情报，冲进去后，一组找到了上二楼的楼梯，冲上去打死了几个没有来得及跳窗逃走的乌干达士兵，另一组没有找到楼梯，回到门前广场上，参加对塔台的火力压制。
以色列特种兵冲入候机厅
塔台上的乌干达士兵顽强射击，要冲上去就要变成从建筑内部啃过去的攻坚战，计划里就没有这么要求，只要求吉普上机枪火力压制。但塔台上的乌干达火力一直压制不住，直到最后人质从塔台前广场撤退的时候也没有完全压制住。幸好这几个乌干达士兵的枪法很糟糕，什么目标都没有击中。
在滑行道的另一边，伞兵徒步向新航站楼潜行，营救人质这边枪声一响，立刻冲了进去，除了一名士兵突然遭遇一名乌干达警察，脖子上挨了一枪，没有遇到其他抵抗，很快控制了新航站楼。肖姆龙和他的指挥组在黑暗中等待二号机降落，但二号机降落的时候，主要战斗实际上已经结束了。三号机紧跟着降落的时候，机场当局终于清醒过来，关闭了跑道灯，三号机最后是用伞兵布放的着陆引导灯着陆的。四号机也跟着降了下来。
二号机、三号机上的装甲车冲下来后，按计划向旧航站楼周边布防，一辆车压制塔台，两辆警戒通向城里的公路，一辆车警戒乌干达空军停机坪方向。当看到旧航站楼这边已经在打扫战场，警戒空军停机坪方向的装甲车要求摧毁停放的战斗机。与此同时，空中的亚当正下令摧毁停放的战斗机，免得乌干达空军想起来起飞追击，但肖姆龙正忙着撤退人质，没有顾得上转达命令。装甲车按照起飞前的作战预案，规定可以忙里偷闲击毁停放的战斗机，于是自说自话扫射起来，无意中执行了亚当的命令，5架米格-21，3架米格-17，统统在瞬间被打满弹洞，有几架起火爆炸。