ATFLIR瞄准吊舱的红外成像
APG-73具有合成孔径等高级空对地模式，通过交错使用机动目标指示模式和地表绘图模式，雷达对地面和海上目标都有很好的辨识能力。未来的APG-79有源相控阵雷达（原APG-73 RUG III）衍生自APG-73，使用固态主动电子扫描天线阵列取代了平面阵列天线。这将使雷达具有并发分时操作各模式的能力，改善了抗干扰能力，并通过大大减少旁瓣来减少可探测性。
“超级大黄蜂”的核心航电计算机基于军事化的商用现货VMEbus总线PowerPC处理器，性能比F/A-18C的16位AN/AYK-14计算机的处理器强百倍，这在长期保障性上是一个显著进步，并为机载飞行作战软件的升级提供了一个非常强大的平台。座舱软件通过MIL-STD-1553B架构总线进行高度集成，并有把MIDS数据链、RWR威胁信息和数字动态地图进行显示融合的能力。
预生产型飞机的座舱混合采用了CRT和AMLCD显示器，生产型全部采用与高分辨率夜视镜兼容的AMLCD显示器。JHMCS头盔显示器将被用来为新的推力矢量AIM-9X导弹指示目标，以后也能为空面武器进行指示。
“超级大黄蜂”的电子战自卫套件围绕着最新型ALR-67告警接收机设计，此外还包括ALQ-165 ASPJ自卫干扰机，以及LE-50拖曳诱饵和ALE-47干扰弹发射器，目前的进一步发展计划包括ALQ-214射频干扰机和ALE-55光纤拖曳诱饵。新干扰机对新型单脉冲威胁系统特别有效，能提供长基线交叉眼堵塞干扰。
F/A-18E/F现有航电配置是MIL-STD-1553B总线架构航电中较先进的，仅次于F-22A和F-35，F/A-18E/F的进一步改进型也许会用上JSF的航电技术。
就总体而言，F/A-18E/F的技术水平与F-15C后期改型相当接近。虽然不具备安装APG-63(V)2主动相控阵雷达的F-15C的超音速优化机翼、顶级超视距空战能力和超音速敏捷性能，但有着更先进的航电、更小的雷达截面积和更现代化的自卫套件。最关键的是，“超级大黄蜂”对F/A-18A-D进行了实质性的改进，特别是在作战半径方面。虽然“超级大黄蜂”经常被批超音速敏捷性差和推重比没有增长，但这两点并不是该机的主要设计目标。“超级大黄蜂”是一个用成熟技术改进F/A-18C的短期低风险低投资项目，用隐身、综合MIDS数据链和先进电子对抗技术显著提高了飞机的生存能力和杀伤力，同时无需承担全新设计的庞大投资。
波音公司和美国海军已经为“超级大黄蜂”规划了未来航电和武器改进计划，用F-22/JSF技术改进的新F414发动机也被认为是极具吸引力的选项，不过至今仍无着落。美国海军也致力于发展F/A-18F的电子战改型E/A-18G，用于取代经常被批速度太慢跟不上打击机群的EA-6B“徘徊者”。E/A-18G是性能先进的护航干扰机和“哈姆”射手，翼尖安装接收吊舱，M-61机炮被航电包取代，翼下可混合挂载大功率ALQ-99干扰吊舱和AGM-88“哈姆”或其他反辐射导弹。这架飞机把F-4G“野鼬鼠”、EF-111A、EA-6B的能力融为一身，同时保留了F/A-18F的大部分作战能力。
F/A-18E/F能挂载4个1800升副油箱和一个伙伴加油吊舱作为舰载加油机使用，在KS-3“北欧海盗”退役后，F/A-18E/F成为舰载联队的唯一加油机资产。与KA-6D和KS-3相比，“超级大黄蜂”的自卫能力更强，速度更快，在紧急加油任务或快速反应任务中效率更高。
挂载4个1800升副油箱和一个伙伴加油吊舱的F/A-18F
美国海军的目标是寻找一种能替换F-14/A-6以及F/A-18A-D的低风险战斗机，而且研制时间和预算都有限制，并且还能填补高风险高性能的隐身JSF战斗机服役前的空缺，F/A-18E/F显然做到了这一点。
试飞“超级大黄蜂”
座舱视角
身为防务分析家和作家，我能经常获得试飞一些非常有趣的飞机的机会。在2001年的阿瓦隆航展，波音公司慷慨地邀请我飞一下F/A-18F“超级大黄蜂”，而且还是配备了数字飞行控制系统的最新批次。这架飞机的表现远远超过了我对操纵品质和座舱易用性方面的期望。
本文作者卡罗尔·柯普博士坐进F/A-18F BuNo 165797的后座舱
这架飞机的序列号是BuNo 165797，是参加阿瓦隆航展的两架“超级大黄蜂”生产型飞机中的一架，被美国海军勒莫尔航空站用于武器投掷试验。这些飞机都安装了保密的软件版本，版本号18EI“V”。
这些飞机的座舱是早期批次生产型状态，采用阴极射线管左右多功能显示器（MFD）和前上方触摸控制（UFC）面板，但中央动态地图显示器是全彩AMLCD面板，后座舱的中央MFD置于UFC面板上方。
早期生产批次“超级大黄蜂”的前座舱
后续批次生产型将在包括UFC在内的所有显示器上使用高分辨率彩色AMLCD面板，后座的中央MFD改到UFC面板下方，采用更大的8×10英寸的AMLCD显示器显示战术态势和移动地图。后座无法在MFD或UFC上显示前座HUD视频。
后续生产批次“超级大黄蜂”的后座舱
座舱布局遵循“大黄蜂”最新批次的基本风格，但改进了发动机和燃油状态显示，波音根据飞行员反馈意见恢复了面板上的最低剩余油量旋转设置开关。
座舱采用了标准中置操纵杆和传统油门杆，但只有方向舵踏板没有机械连接结构。武器系统的模式选择和控制开关都在HOTAS操纵杆上，总空空和空地模式选择开关在仪表面板右上方。面板上还有一个开关用于在电子静默作战中关闭飞机的所有电子辐射。
和波音客机的现代驾驶舱一样，“超级大黄蜂”的座舱经过了精心布置，非常易于操作，并能在任何一个显示器上调出你想要的信息。我驾驶的这架飞机被设置为左MFD显示HUD符号，中央MFD显示叠加了导航符号和指南针的动态地图，右MFD显示雷达信息。