F-18E 在气动设计上继承了 F-18 基本型的基本布局，但在尺寸和重量之外，还有一些重要的细节差别。F-18E 的大边条更加饱满，产生涡升力的效果更加显著，这反映了边条技术的成熟和麦道（现并入波音）在设计上的自信。F-18 基本型的翼根有一道开槽，这是用来泄放进气口边界层呆滞气流的。在 YF-17 的设计上，开槽较长，泄放的气流同时形成“气墙”，可以控制边条涡的走向。但试飞表明，这引起较大的阻力。缩短开槽降低了阻力，但引起边条涡走向不好控制以至于敲击垂尾的问题，导致垂尾结构损坏。后来麦道在翼根增加了一对小小的像翼刀一样的扰流片，控制边条涡的走向，解决了边条涡对垂尾的敲击问题。F-18E 采用了和基本型完全不同的进气口设计，斜菱形进气口不仅具有一定的隐身作用，还把边界层呆滞气流改道，改为翼下横向泄放。这样不需要穿过翼根结构，进一步解放了翼根的容积，提供了额外的贮存燃油的空间，还进一步降低了阻力。边条涡走向控制则由全新设计的大边条解决。除了增大的机内载油量，气动设计上降低阻力也有助于 F-18E 达到增加航程的目标。F-18E 在试飞中发现了不对称翼尖失速问题，导致一侧机翼突然丧失部分升力，引起不受控制的横滚。麦道在机翼中段增加了一排穿透机翼结构的导气孔，由下表面高压气流穿过小孔形成“气墙”，实际上相当于虚拟翼刀。
F-18E 得益于 30 年来的电子技术进步，不仅座舱进一步玻璃化，还装备了新型雷达、电子对抗系统、数据链、火控计算机、导航等新型设备，早期 F-18E 还是使用机械扫描的雷达，现在已经过渡到主动电扫雷达，其多波束能力不仅有利于加强多目标空战能力，还可以在对地攻击中同时完成地形跟踪、对地火控和空中警戒任务。专用化改装和加挂电子战吊舱后，F-18G 不仅替代 EA-6 电子战飞机，还保留空战能力。第一次在空战演习中“击落”F-22 的就是一架 F-18G。即使在 F-35 服役后，F-18E 依然将继续作为美国海军未来几十年里的主要制空战斗机。澳大利亚也选择了 F-18E 替代其 F-18A 战斗机，对于加拿大，F-18E 也是一个自然的选择。
但加拿大选择了 F-35。F-35 是美国为了替代 F-16、F-18 和 AV-8 而研制的第五代战斗机，分为美国海军的 F-35C、美国海军陆战队的 F-35B 和美国空军的 F-35A。F-35A/B/C 之间的差别很大，远远超过亚型那么简单。F-35C 的 CATOBAR（弹射起飞、拦阻索助降）能力和 F-35B 的 STOVL（短距起飞、垂直降落）能力对于大多数盟国来说不感兴趣，CTOL（常规跑道起飞降落）的 F-35A 将成为出口的主力，也将是加拿大的选择，这是作为 F-22 的低成本搭档设计的。和 F-15、F-16 的搭配类似，F-22 将作为空战主力，F-35 在 F-22 忙不过来的时候帮一把手，或者在次要方向上填补空隙。
但是加拿大选择了 F-35
这是和 F-22 搭档的战斗轰炸机，也担任次要方向上的制空作战
F-35 有空军用的常规起落的 A 型，海军陆战队的垂直起落的 B 型，还有海军的航母弹射起飞、拦阻索降落的 C 型，加拿大应该选择的是 A 型
和 F-22 拓展空战战术和航空技术前沿的设计理念不同的是，F-35 是按照成本设计的，设计理念是控制风险和降低成本。所以 F-35 不仅放弃了超音速巡航的要求，甚至最大速度不及 F-16 和 F-18，在隐身上也放弃了 F-2 2的全向隐身的要求，而只要求前向隐身。F-35 在机动性上也降低了要求，只要求“不低于 F-16”。由于隐身设计的机内载弹要求，大小和 F-16 相仿的 F-35 远为“肥胖”，空重、正常起飞重量和最大起飞重量竟然全面超过 F-15C，尽管采用世界上单台推力最大的 F135 发动机，仍然推力不足，推重比只相当于 F-4“鬼怪”式，而对机动性至关重要的另一项指标翼载则只相当于有“人操火箭”恶名的 F-104，仍然大大落后于 F-15 和 F-16。F-35 的实际机动性是否能达到“不低于 F-16”的水平是一个很大的问号。
F-35 是为对地攻击而优化的。两侧的机内弹舱可以各挂载一枚 2,000 磅（910 公斤）炸弹和一枚空空导弹（AIM-9X 红外制导近程空空导弹或 AIM-120 主动雷达制导中程空空导弹），或者 3 枚 SDB 小直径炸弹，或者其它武器。用作对地攻击时，这样的载弹量虽然嫌少，但载弹搭配还算不错。AIM-9X 的挂架和舱门联动，打开伸展后导弹暴露于空气中，然后点火发射。炸弹挂架在舱内，投弹时靠重力自由下落，脱离挂架。由于 AIM-9X 是从挂架上点火直接发射出去的，而不是像炸弹一下投下然后在空中点火，炸弹挂架不能用于挂载 AIM-9X，所以在空战任务时，即使炸弹挂架空着，也不能用于挂载更多的 AIM-9X。也就是说，在无外挂隐身出击时，如果不算航炮的话，F-35 将只有两枚 AIM-9X 可供空战使用。当然，F-35 可以加上翼下挂架，大大增加载弹量，但那样的话，F-35 的隐身将荡然无存，在机动性和速度不占优的情况下，和苏-27、F-16 那一代的第四代战斗机相比更无优势可言。F-35 的电子系统先进，具有网络战能力，但苏-27、F-16 是可以通过升级达到同等能力的。
在 F-35C 服役后，美国海军将逐步退役 F-18C，但保留 F-18E 作为空战主力，F-35C 则作为对地、对海攻击主力。舰载航空兵的空战任务以防空截击为主，隐身能力较差不是太大的缺点，挂载空空导弹的数量和远射能力更为重要。另一方面，隐身对于对地、对海攻击的突防十分重要，继续依赖 F-18E 就勉为其难了。F-18E 和 F-35 这样的搭配是合理的。对于美国空军来说，F-22 将继续作为空战主力，F-35 的空战能力主要用于填平补缺，主要用于对地攻击也是一个合理搭配。但对于加拿大空军来说，情况就不同了。