2007年，AIM-120B被更先进的AIM-120C5取代，这种新型号大大提高了抗干扰能力，并增大了射程和战斗部威力。
“狂风”F3的前机身右侧保留了一门27毫米毛瑟机炮，飞机配备有完善的自卫套件，除雷达告警接收机外还有箔条和热焰弹发射器。
在北约干涉南斯拉夫的“禁飞”行动中，由于存在地空导弹的威胁，所有没有装备干扰机的北约战斗机被禁止飞入战区。于是“狂风”F3紧急加装了拖曳雷达诱饵（TRD）和外挂干扰吊舱，升级后的F3首先装备了第29战斗机中队。
在2003年的伊拉克战争期间，几架“狂风”F3被改装成“野鼬鼠”战斗机，预定执行压制敌防空系统的任务，编号也变成了EF3。该机能挂载两枚“阿拉姆”反辐射导弹，凭借自身的雷达定位与告警接收机和软件算法，自卫套件可摇身变成效果良好的辐射定位系统（ELS）。
F3作战评估部队和利明基地的联队对EF3进行了测试，但最后决定不在作战中使用该机。
雷达和数据链
由于早期对“猎狐手”雷达升级未能改善其性能，所以英国国防部与英国宇航公司签订了一份3.95亿英镑的合同，分三阶段提高雷达性能，等第3阶段升级完毕，F3终于发挥出了全部作战潜力。
Link 16联合战术信息分发系统（JTIDS）的引入大大提高了机组的态势感知（SA）能力。F3是英国第一种装备这种数据链的战斗机，能通过这种高度保密的抗干扰数据链从E-3D“哨兵”预警机获得目标实时信息。
目标信息可以显示在武器系统军官的雷达和战术显示器或下视显示器上，系统还能显示所有Link 16数据链用户的位置和状态，让机组查看自己僚机的状态和位置，数据链提供了僚机的航向、高度、速度、燃料和武器状态，再也无需通过无线电报告。
Link 16也意味着机组间可以分享彼此的雷达数据，因此编队中的一架飞机可以让雷达上视，另一架下视，这样他们都能同时看到两个雷达图像。该功能还能使机组看到自己雷达覆盖区域之外的雷达图像。
“狂风”F3的机组也可以使用Link 16把信息发送给预警机或地面部队，地面部队也可反过来把信息发送到座舱。
作战行动
在英国皇家空军中服役的高峰期，有7个一线中队装备了“狂风”F3。在皇家空军利明基地，先后有第11、23和25中队装备了该机。
皇家空军的“狂风”中队，无论是装备IDS还是ADV的，从1990年8月第一架“狂风”抵达沙特参加“沙漠盾牌”行动时，就几乎连续参加了一系列作战行动。
