据此，三机部于 1979 年 3 月 10 日下达了《关于抓紧开展歼-13 飞机选用涡喷-15 发动机方案论证的通知》。通知指出：为了进一步提高歼-13 飞机的战术技术性能，拟选用涡喷-15 发动机作为歼-13 的动力装置，并已报请军委科学技术装备委员会审定，请组织力量迅速开展歼-13 飞机选用涡喷-15 发动机为动力的方案论证工作，并于 5 月中旬将论证结果报到三机部。
根据三机部发《通知》的要求，沈阳飞机设计研究所立即组织力量，在原来多次动力装置论证的基础上，经过近两个月的论证，于 5 月 8 日向三机部报送了《对歼-13 飞机装用涡喷-15 发动机工作的意见》。认为歼-13 飞机改用涡喷-15 发动机，在某些方面优于涡扇-6，在现实性和把握性上，涡扇-6 也不及涡喷-15，因此，建议方案工作应转到改用涡喷-15 上来，进一步明确涡喷-15 装歼-13 飞机的技术要求，用三个月的时间详细作出总体安排后，再进行方案论证工作。10 月 9 日，三机部在沈阳召开了歼-13 飞机装用涡喷-15 发动机方案论证会，通过了方案审查，这个方案大大超过了当初的指标，接近美国 F-16 飞机的水平，海平面上升率达到 300 米/秒。12 月中旬，莫文祥副部长来沈阳飞机设计研究所听取了歼-13 研制工作的汇报。1980 年 3 月，总参和国务院国防工办正式批准了改用涡喷-15 发动机作为歼-13 的动力装置。
在此后的 1 年多时间里，考虑到飞机动力装置的更改和歼-13 飞机性能的不断提高，以及空军对歼-13 的战术技术指标又提出了补充要求，即：要通过改进使飞机具有使用导弹进行拦射的能力；最大飞行表速要从 1,200 千米/时扩大到 1,350 千米/时；机动性指标要进一步提高；并希望能按改装涡喷-15 发动机的方案接近上限数据等等。由于战术技术要求迟迟冻结不了，加之空军与设计部门就战术技术要求的磋商，一直持续到 1980 年 10 月份。1980 年 10 月国防工办、总参正式明确涡喷-15 发动机为歼-13 飞机的动力装置。1981 年，606 所与 601 所协调，提供了涡喷-15 发动机的高度、速度特性。
1978 年，十一届三中全会后实行改革开放，随后党的十三大上提出了“以经济建设为中心”的基本路线，军队建设也不得不为经济建设让路。而歼-13 格斗歼击机也因国民经济和空军装备发展规划的调整，不得不于 1981 年 3 月停止研制。
然而在这一时期，国际形势阴云密布，中国开始受到外界的严重威胁，而装备发展长期停滞的中国空军压力也越来越大。而另一方面，随着我国改革开放经济建设的发展以及国力增强，空军开始寻求新一代歼击机，并经中央军委批准后提出了新型歼击机的技术指标。1982 年 2 月，国防工办在北京召开新机研制座谈会，会上提出新型歼击机的空战能力要优于现有的歼-8II 以及苏联当时的米格-23 歼击机，争取性能接近美制 F-16 战斗机。
与此同时，虽然沈阳飞机设计研究所对歼-13 的研制工作不得不暂停，但是边条翼的研究工作并未停滞，新的边条翼与漩涡分离研究课题也于 1980 年立项并下达北航，经过深入细致的理论分析和计算，陆续取得了大量的综合性研究成果。根据新的气动研究成果，机腹进气方案进行了较大量的修改，形成了新一代带边条翼正常式布局高机动空战战斗机方案。而在歼-13 基础上重生的沈阳飞机设计研究所新型边条翼布局格斗战斗机参加了国内新一代战斗机竞争，同时参加竞争的还有成都飞机设计研究所在歼-9 飞机基础上发展的鸭式布局方案和南昌飞机制造厂设计室在强-6 飞机基础上的可变后掠翼方案。而这一时期空军装备体系重新调整了命名，取消了包括歼-9、歼-13 和强-6 在内的名称，重新给予当时的其他在研项目，而我国未来第三代歼击机的这三个方案统归为十号方案。
南昌飞机制造厂的可变后掠翼方案由于研制难度、可靠性和风险等一系列问题，在对比中处于比较低的位置。而 601 所的边条翼布局方案和 611 所的鸭式布局方案则是主要对比考虑对象。在两者的比较中，空军更倾向于成都飞机设计研究所的鸭式布局方案。主要原因是，鉴于当时的主要假想敌的地理位置和入侵方向，空军希望未来的新型歼击机最好不要在靠北的地区生产；当时的很多高机动战斗机都采用了鸭式布局，很显然鸭式布局是一种非常时髦的方案；鸭式布局方案的研制有比较可靠的技术支持；以及一些意志原因。最后空军确定我国未来的新型格斗歼击机采用鸭式布局方案，后来也就诞生了现在的歼-10 第三代歼击机。而歼-13 飞机，至此正式告一段落。
附在后面：
笔者大约十年前的复原作品，是在采访陈应明老先生后通过口述复原的
笔者很早就听闻，已经终止研制的歼-13 飞机后来采用了机腹进气布局，当即信手涂鸦复原了一张“想象图”，然而多年之后才得以见其真身。现在回想起来，在原来的歼-13 基础上发展的机腹进气型歼-13II 与笔者当年想象之作品相差其实倒不大。而本人唯一没有想到的是，真正的歼-13II 机头座舱高高昂起——一反此前米格系列以及歼-8 飞机座舱深埋入机身的设计风格，这种设计主要为了获得良好的视野，而这也是第三代战斗机的标志。目前见到的各种机腹进气型歼-13II，存在两种翼刀构型，一种与歼-8II 之翼刀几乎无异，作用也近似；另一种的翼刀布置在边条机翼上——与 F/A-18 的非常相像，估计也具备脱体涡控制的作用。沈阳飞机设计研究所在歼-13 基础上发展的机腹进气战斗机方案性能已经再次有了飞跃，但由于太多的其他原因影响，最终在竞争中败给了成都飞机设计研究所的鸭式布局方案。
