经过大量的试验比较。最后歼-13 确定采用了带前缘机动襟翼的边条机翼，进气道则用腹部进气形式。
之所以采用边条机翼布局，也是出于提高飞机机动性方面考虑。边条翼是 20 世纪 50 年代中期出现的一种新型机翼。这种边条翼是在中等后掠角的机翼根部前缘处，加装一后掠角很大的细长翼所形成的复合机翼，称为边条翼。在边条翼中，原后掠翼称为基本翼，附加的细长前翼部分称为边条。目前很多第三代强调高机动的战斗机采用了这种机翼。
边条翼的气动特点是，在亚、跨音速范围内，当迎角不大时，气流就从边条前缘分离，形成一个稳定的前缘脱体涡，在前缘脱体涡的诱导作用下，不但可使基本翼内翼段的升力有较大幅度的增加，还使外翼段的气流受到控制，在一定的迎角范围内不发生无规则的分离，从而提高了机翼的临界迎角和抖振边界，保证飞机具有良好的亚、跨音速气动特性。在超音速状态下，由于加装边条后，使内翼段部分的相对厚度变小，机翼的等效后掠角增大，可明显降低激波阻力。另外，边条的存在，还可使飞机在跨音速和超音速飞行时的全机焦点后移量减小，导致飞机的配平阻力降低。因此，这种机翼也具有良好的超音速气动特性。边条翼的缺点是，在小迎角范围内，其升阻特性不如无边条的基本翼好；它的力矩特性也不理想，力矩曲线随迎角的变化呈非线性。由于涡升力的存在，导致飞机焦点前移，造成俯仰力矩的非线性变化，甚至可能造成无法抑制的上仰失速。要想利用传统的机械-液压操纵系统进行控制是个不小的难题。并且边条面积越大，俯仰力矩的非线性变化也越剧烈。
很显然，边条机翼并非完美，而且由于处在涡流流场中的部分翼面容易产生抖振，引起结构疲劳。为此，歼-13 飞机在结构上，对采用的多墙多支柱结构的机翼，进行了 5 种不同受力构架的打样和强度、颤振、静气动弹性的综合优化设计计算。对机身起落架进行了专门打样。此外，还进行了全蜂窝直轴平尾的设计制造一体化研究。
美制 F-5 战斗机，该机作为一种战斗机历史上的经典，在不断的改进过程中飞机不断修改和扩大边条机翼的样式，是利用边条翼提高机动性的典范
此外，沈阳飞机设计研究所还对歼-13 飞机的武器火控系统和机载电子设备的配套方案，以及飞机各系统的原理方案、主要成品附件，均进行了比较充分的研究和论证。为加强火力，机翼上多加挂点，采用了机身起落架。为控制飞机最大起飞重量，飞机仍然要分型，大量生产的是白天型，不装雷达只装测距仪；另外少量生产装雷达的型号，只作全天候截击使用，机动性要差一些。火力则是航炮与近距格斗导弹并重。
歼-13 一直得到空军的重视，空军科研部主动介绍沈阳飞机设计研究所前往部队征求意见，部队对这样的歼击机方案也很满意。同时，空军还组织有关空勤、地勤人员去 601 所参加歼-13 的设计工作。
1977 年 6 月，第三机械工业部在北京召开了歼-13 方案论证会。会议对飞机总体、气动、结构、材料及各个主要系统进行了认真的论证、审查。认为“飞机的总体方案是先进的、可行的，经过努力是可以实现的。设计上采取的机翼边条、前缘机动襟翼、后缘双缝襟翼等，对于提高飞机的性能是较好的措施。对于飞机的进气方式，在比较了两侧进气及腹部进气两种方式后，倾向于采用腹部进气方案，但要在 601 所的试验研究工作较为充分再作最后确定”。同年 7 月 3 日至 8 日和 11 日至 22 日，三机部先后又在沈阳、西安召开了歼-13 飞机座舱布置方案讨论会和火控系统总体方案论证会。根据上述精神和部、院的指示，经与空军歼-13 研制三结合小组以及工厂有关人员进行讨论研究，对原设计方案进行了修改和充实。12 月 20 日，向部报送了《歼-13 初步设计方案》，并请部审查后提交常规装备发展领导小组审批。
1978 年 2 月 5 日，三机部转发国务院、中央军委常规装备发展领导小组《关于歼-6 后继机主要战术技术要求的批复》。在转发通知中指出：中央军委科学技术装备委员会最近指示，歼-13 飞机为重点研制项目，厂、所一定要加强领导，“精心设计，精心施工”，保证《批复》的要求。通知确定，歼-6 后继机定名为歼-13，研制定点沈阳飞机制造厂，要求厂、所尽快制定并上报歼-13 飞机研制规划。3 月 29 日，吕东部长来到沈阳飞机设计研究所听了歼-13 飞机设计工作的汇报，认为该机作为第三代歼击机，无论在性能上和武器装备上都不够先进，要求再作努力，提高歼-13 飞机战术技术性能。根据吕部长的指示，沈阳飞机制造厂和沈阳飞机设计研究所经过认真细致的分析研究、试验和计算，于 6 月 17 日联合向三机部呈报了《关于歼-13 飞机研制方案的报告》。具体提出了该机的战术技术指标和要求；主要配套产品和新材料项目；设计定型需要研制的架数；参加三结合的使用单位和研制阶段进度、设计定型时间，以及研制经费概算、需要增加的土建项目、设备等问题。
1978 年 2 月，三机部在西安市召开了歼-13 成品协调会。歼-13 采用的 150 项新成品，有 80% 定了点、签订了技术协议，为歼-13 飞机的研制工作打下了基础。
而就在半年后的 1978 年 9 月，我国从埃及引进了一架米格-23MS 飞机，这架米格-23 在某种程度上改变了歼-13 的命运。
美国空军第三代高机动战斗机 F-15 的竞争计划 FX 中，作为备选的北美公司 NA-335 方案。该方案在机腹布置的矩形进气口、高昂的机头，以及单垂尾单腹鳍带边条翼上单翼正常式布局，与我国的歼-13II 格斗战斗机方案形神兼似
美国空军第三代高机动战斗机 F-16 的竞争计划 LWF 中，作为备选的波音公司 908-909 方案。与我国的歼-13II 相比，同样采用了机腹布置的矩形进气口、高昂的机头，以及带边条翼的正常式布局
美国海军第三代高机动战斗机 F/A-18 的竞争计划 VFAX 中，作为备选的沃特公司 V-523 方案。布局酷似我国的歼-13II
关于这架特别的米格-23，还要从当时的国际形势说起。70 年代末 80 年代初，非洲一些国家的政治态度发生了改变，绝大多数这样的事件使得冷战的东西方有机会接触到对方的军事科技。在 1974 年，埃塞俄比亚成了苏联和古巴的好朋友，因而苏联人顺理成章地测试了埃塞俄比亚的 F-5E。对此，索马里立即转向中国和西方寻求帮助，交换条件是提供他们的基地和米格-21。