崭新的 B-17G 在波音机场排成一列，这个时期出于目视识别的需要，航空军新出厂的飞机都去掉了涂装
绰号“夏延”（Cheyenne）尾炮塔从 B-17G-80-BO/-45-DL/-35-VE 批次的飞机中引入。新的炮塔配备了反射式瞄准具而不是以前的圆圈准星，由于更换了尾炮塔，这些 B-17G 比早期型短了 12.7 厘米。B-17G 后期型中，腰部机枪窗口也交错排列，防止左右炮手互相干扰。
“夏延”尾炮塔（左）与老式尾炮塔的对比
在最后的批次中（B-17G-10 5至 -110-BO、B-17G-75 至 -85-DL、B-17G-85 至 -110-VE），去掉了无线电操作员的机枪，这样使腰部机枪的弹药增加到 600 发。
1945 年生产结束时，波音生产了 4,035 架的 B-17G，道格拉斯生产 2,395 架，洛克希德-威加生产 2,250 架。波音生产的最后一架 B-17G 在 1945 年 4 月 13 日交付。
B-17G-1-VE 42-38940 用于测试用途，型号改为 XB-17G。
B-17G 性能规格表 发动机：4 具赖特 R-1820-97“旋风”星型发动机，配备通用电气 B-22 涡轮增压器，起飞功率 1,200 马力，高度 7,620 米时 1,000 马力，短时间内紧急功率可达 1,380 马力（8,138 米）。 性能： 最大时速 423 公里（7,620 米）/483 公里（9,144 米，紧急功率），巡航时速 241 公里（7,620 米），着陆时速 145 公里。初始爬升率 274 米/分，爬升至 6,096 米高度耗时 37 分，实用升限 10,668 米。最大航程 2,977 公里（载弹 1,814 千克，7,620 米高度，载油 10,636 升）。 重量： 空重 14,842 千克，正常起飞重量 24,948 千克，最大起飞重量 32,659 千克。 燃料： 正常燃料容量 9,538 升，携带了额外油箱后总燃料容量 13,671 升。 尺寸： 翼展 31.63 米，全长 22.78 米，全高 5.82 米，翼面积 131.92 平方米。 军械：13 挺 12.7 毫米，颚部炮塔两挺，颊部机枪两挺，机背炮塔两挺，腹部炮塔两挺，无线电操作员一挺，腰部机枪两挺，尾部炮塔两挺。短航程最大载弹量 7,983 千克。
有 85 架 USAAF 的 B-17G 援助英国，英国空军称之为堡垒 III。其中的首批 30 架是由波音生产的，其余都是洛克希德-威加生产的。英国空军序列号如下： HB761-HB790（波音） HB791-793、HB795、HB796、HB799-803、HB805、HB815-820、KH998、KH999、KJ100-127、KL830-837（威加） 依循惯例，一部分堡垒 III 进入被空军海防总队服役，拆除了颊部机枪和腹部炮塔，并在腹部炮塔的位置安装了搜索雷达。在反潜任务中通常挂载十二枚 181 千克反潜炸弹或十六枚 113 千克深水炸弹。
1944 年 2 月，堡垒 III 进入轰炸机司令部的第 214 中队服役，基地位于斯克尔索普（Sculthorpe）。第 214 中队和基地位于奥尔斯索普（Oulthorpe）的第 223 中队一起编入第 100 大队，他们装备的堡垒 III 专用于干扰敌人防空雷达。除此之外，还经常参加英国空军的夜袭，任务是投放金属干扰丝干扰敌方雷达或作为佯动兵力迷惑敌夜间战斗机。1945 年 7 月，两个中队解散，剩余少数堡垒 III 用于气象侦察。
第 223 中队的特殊堡垒 III，用于干扰和情报任务
欧洲战场的 B-17
1942 年 1 月，第8航空军在佐治亚州萨凡纳（Savannah）创建，同年 2 月第 8 航空军番号改为第 8 轰炸机司令部，23 日先头部队移师英国。第 8 轰炸机司令部主要担负对德国目标的白天轰炸任务，在二战中装备过 B-17、B-24、B-25和 B-26 等轰炸机。1944 年 2 月 22 日，第 8 轰炸机司令部又重新改回第 8 航空军的名称。
在对德轰炸问题上，USAAF 坚持进行白天高空轰炸，B-17 的防御火力被认为足够来对付德国空军的战斗机，而英国空军奉行夜间轰炸战略。
1942 年 7 月 1 日，USAAF 的首架飞行堡垒（B-17E 41-9085）飞抵苏格兰普莱斯威克（Prestwick），1942 年 8 月 17 日，第 97 轰炸机大队的 18 架 B-17E 进行了对欧洲大陆的第一次空袭，目标是法国卢昂-索特威尔（Rouen-Sotteville）的铁路调度场。其中 12 架实施了轰炸，其余 6 架在法国海岸上空佯动。第 8 轰炸机司令部司令艾拉.埃克（Ira Eaker）准将亲自坐镇 B-17E 41-9023“美国佬”（Yankee Doodle）号参与行动。轰炸机编队由英国空军的喷火战斗机护航，没有遇到德国空军拦截。
8 月 19 日，24 架飞行堡垒参与了对法国境内的德军阿布维尔（Abbeville）机场的轰炸，这是一次为了支援加拿大军队在迪耶普（Dieppe）登陆的行动，所有飞机安全返回基地，但是在迪耶普的盟军全军覆没。接下来的十次轰炸行动都很顺利，损失两架飞机。
由于欧洲天气恶化，而且北非战事吃紧。第 8 轰炸机司令部作战计划有所改变，大多数的 B-17 都准备用来阻止隆美尔的攻势，其中最富经验的两个轰炸机大队：第 97 和第 301 大队作为新组建的第 12 航空军的核心投入到“火炬行动”中去。1942 年 9 月 20 日，杜立特将军赴英国上任第 12 航空军司令，10 月初，第 8 轰炸机司令部的第 97、99、301 和第 2 轰炸机大队都被转移给第 12 航空军，对欧洲大陆的轰炸被放到次要地位。
1942 年 10 月，空虚的第 8 轰炸机司令部将注意力集中到法国沿岸的的德国潜艇坞上，这些潜艇坞由厚厚的钢筋混凝土构成，普通炸弹对它没有什么效果。由于天气原因，许多炸弹由于无法瞄准目标而炸偏，对这些船坞的袭击没有多大战果，飞机和机组却遭受了损失，看来对付潜艇威胁的最好办法还是在海上予以歼灭。