巨大的消耗使得航母在作战期间每3～4天就要接受一次综合补给，而海上伴随保障就提供了80%的补给量，通常采用纵向、横向和垂直输送相结合的立体化补给方式。纵向补给也称船尾补给，由补给船从船尾放出管道与跟在后方的船只相连，操作简单，但只适用于输送液体物品。横向补给又称舷侧补给，在补给船与接收船并列同向航行当中，通过双方设在舷侧的多个补给站利用索具、吊杆等连接装置输送弹药、液货、干货等物资。垂直补给则是由直升机装载或吊运成箱货物，灵活性很高，尤其适合拥有宽大甲板的航母，必要时还可派出舰载固定翼运输机运送急需的物品。
重型海上补给系统一次最多可以运输5吨货物
由于实施补给时各舰艇都要降低航速、停止攻击行动，为避免贻误战机或遭敌偷袭，必须尽可能缩短物资输送的时间。补给船上储存的货品事先就要分门别类地进行标准化包装，采用机械化仓储技术，便于按需要快速调运到甲板上，再通过高速传送装置和直升机转运出去。目前美军航母接受一次综合补给所需的时间估计为3～5个小时，而正在研制的“重型海上补给系统”将比传统的标准补给方式更为快捷和安全，可在5级海况下一次横向运送超过5吨的重型货物，并进一步提高操作的自动化程度，减少所需人力，有效缩短航母补充各类物资的时间。
MH-60S直升机向航母甲板吊运武器
C-2“灰狗”舰载运输机负责向航母运输人员、小件货物和邮件
周到细致的医疗保障
虽说现代化的航空母舰在工作和生活条件上比中小型舰艇要好很多，但毕竟还是一台作战机器而非豪华游轮。航母长期处于气象复杂的大洋深处，舰上机械、电子设备众多，装载着大量化工产品和危险品，充满各种噪音、振动、辐射和有害气体。在这样的环境下，舰上人员每天都要从事快节奏高负荷的体力或脑力工作，身心压力大，引发伤病在所难免，严重时会削弱战斗力。为了维护本舰以及整个航母编队的卫生条件和人员健康，航母利用内部空间大的优势设立了多功能的医疗部门，提供较为全面的医疗保障服务。
“尼米兹”级航母上的医疗部门相当于一所综合性的小型医院，设有体检室、化验室、X光室、手术室、药房、普通病房和隔离病房等，拥有各种专业医疗设备和55～80张病床。该部门长配备两名副手，一名负责行政人事业务，另一名负责指导医疗业务。舰上常驻包括高级军医、内外科军医、心理医生在内的9名医务军官，以及34名受过相关培训的医务士官和看护兵，可以实施常规和应急的诊疗或手术。当舰载机联队上舰后还会增派两名航空军医和15名辅助人员，主要为飞行人员提供医疗服务。另外，牙科部门配备有5名牙医和16名助手，为全体舰员进行牙齿和口腔方面的日常检查和医治。他们都接受过急救训练，在战时也可协助抢救伤员。
美军海上医疗保障体系分为三级：舰艇自身保障、伤病员收治保障、医院船保障。航母上的医疗设施比较齐全，具有相当强的独立性，可以承担二级保障，而且工作周期长、职责范围广，因此具体任务也是多种多样。
在平时，航母医疗部门不仅是充当“随舰医院”的作用，为各级舰员开设门诊、急诊及各种临床服务，解决患者的病痛问题，同时还要在舰上开展全面的卫生保健和预防检疫活动，其中包括：对舰员进行定期体检和健康教育，建立健康档案，制定锻炼计划，提高身体和心理素质；针对舰上人员密集、舰队所经地区复杂的特点做好对流行病、传染病的防治工作；对舰上的食品和用水及加工过程进行日常检查，监督各部门对工作和生活场所保持良好的卫生状况，指导环境消毒和控制病虫鼠患，对垃圾废料进行无害化分类处理；为处于噪音、高温、辐射等不良条件下工作的人员提供有效防护；与作战训练相结合，培训舰员在紧急情况下的自救与互救技能，掌握发生核、化、生攻击时的基本应对措施，定期举行模拟演练。
“里根”号航母上正在进行伤员救助训练
在战时，航母医疗部门按照事先制定的各种战伤和事故处理预案对可能出现的大量伤患开展分类救治。在接收各舰艇送来的伤病员后，医护人员对其中特别严重者实施紧急救护，稳定其伤病情。对不同症状的伤病员进行检查确诊，相应采取包括手术在内的各种医治措施，并利用病房及设备进行初步的康复治疗。如果病床不够，还可在航母上的其它空间开设应急救护所。对于需要进一步救治的伤病员，则利用舰载机或交通艇将其后送到附近条件更好的医院船和陆上基地，接受后续治疗。
舰载机飞行人员是海军“精英中的精英”，他们的身心健康和出勤效率直接关系到航母的作战能力，因此航空医学保障也就成为航母医疗工作的重点。在出发前，航空军医要对各飞行机组做全面体检，防止带病上舰。随航母出海后，要对机组人员的日常生活严格把关，确保饮食符合营养和卫生标准，居住舱室保持清洁舒适，减少休息时所受的干扰。在紧张的训练和作战期间，航空军医还要密切关注机组人员的身心状态，判断其是否适合继续飞行，合理运用锻炼、理疗和其它手段及时缓解心理压力和身体疲劳，尽可能使飞行任务不受影响。
分秒必争的救生损管
一支航母战斗群有10艘左右的大小舰艇、近万名官兵和上百架舰载机，长期在海上巡弋，飞行人员和舰员因意外事故或作战损失而落水的情况时有发生。迅速组织救援行动、挽救人员生命也是航母日常活动的重要部分。航母上通常设有一支海上救生分队，负责搜寻和救捞落水人员。这支分队使用两架装有救援设备的直升机，除驾驶人员外还配备有救生员和医护人员。在接到搜救命令后，救援直升机立即出动前往出事海域，通过落水者随身求生装置发出的信号确定其具体位置，或沿着划定的搜索航线利用红外探测和人工目视等手段进行寻找。发现落水者后，直升机接近并悬停在目标上方的固定位置，启动绞车放下吊索，让救生员下到海面帮助落水者套上索具再拉上直升机，随机医护人员在返航途中就可进行必要的急救处理。在平时，各级人员都要学习海上求生技能，而飞行人员还要进行海面迫降和水下逃生训练，以便在救援到来之前争取更多的生存时间。
除了能救人，还要会“救”船。航母本身体积大，在战时是易受攻击的目标；舰上装满各种设备和易燃易爆品，平时发生火灾和爆炸的可能性也比其它舰船要大。虽然二战结束后至今，还没有一艘在役航母因受损而沉没，但航母上的危险意外仍屡见不鲜，美国的常规动力航母和核动力航母上都发生过严重事故。如1967年7月29日，进入越南外海的“弗莱斯特”号航母正在执行轰炸任务，因安全措施不当，甲板上一架飞机挂载的火箭弹突然自行发射，引发一系列爆炸和大火，造成近200人死伤，60多架飞机被毁。航母船体也严重受损，不得不退出战斗返港大修。