超级军旗机的武器配备并非仅限于导弹，其固定武装为该于发动机进气道底部的 2 门 30mm DEFA553 机炮，每门附有 125 发炮弹。机上有 5 处挂载点：机腹中线挂载点可携 590 公斤外载；两处翼下内侧挂载点具 1,090 公斤携载能力；两处翼下内侧下挂载则可承载 450 公斤。在执行攻击任务时，可配备 6 枚 250 公斤炸弹(机腹挂架携载 2 枚)，4 枚 400 公斤炸弹(全由翼下挂架携载)，或 4 具 LRI50 火箭巢，每具火箭巢可容纳 18 枚 68mm 火箭。超级军旗机适常以右翼内侧携挂飞鱼导弹，此时左翼则携挂一具 1,100 公升容量燃料箱以产生平衡作用。
超军旗与飞鱼
超级军旗机的机腹下尚可携带侦察舱(法国海军航空队并未采用)、空中加油设施、或是一具 1 万 5 千吨威力的 AN52 战术核炸弹(自 1989 年开始配备)。翼下外侧挂架各可携挂一枚 MATRA 公司的 R550 魔术红外空空导弹。超级军旗机配备两枚魔法导弹，加上两具 1,100 公升容量的外载燃料箱，则具有 1,200 公里的高-高飞行任务半径，但是超级军旗机在配备两枚空对空导弹时，通常仅携挂一具600公升容量燃料箱。
超军旗拥有伙伴加油能力
为了降低执行打击任务时的脆弱性，法国海军航空队的超级军旗机将自 1988 年开始以法国航宇公司的 ASMP 导弹取代自由抛落式 AN52 核弹，ASMP 导弹的当量在 10 至 15 万吨之间。
ASMP 核导弹
为使超级军旗旗机能配备 ASMP 导弹，机上的导航／攻击系统必须进行修改，因为在发射 ASMP 导弹前，必须将适当的指令输入导弹的导控系统。也因于这个缘故，新一代超级军旗机的航空系统又有所改良，使之具备发射ASMP导弹的能力。
为超军旗挂载激光制导炸弹
航电系统
超军旗座舱布局，下图是现代化改进后的座舱
超级军旗机的鼻部设有一以 I 频段(8至10GHz)操作的龙舌兰单脉波雷达，这种雷达是专门是对海军任务而设计的。龙舌籣雷达拥有搜索、自动追踪及测距能力，可从事空对空及空对地任务，此外尚附有地形图像显示器，并能为主动雷达导引导弹(如飞鱼导弹)提供目标资科。此型雷达的空对海搜索距离为 110 公里；以空对空模式操作时，有效距离为 28 公里其性能通常可使飞机在 40 至 55 公里外侦得如巡逻艇一般大小的水面船只。
机鼻特写
超级军旗机是第一种配有惯性导航系统(INS)的法国军机。原先达索与法国航宇公司希望能采用李顿(Litton)公司的 LN33 导航系统，但最后仍决定采用包含 SAGBM(电机通用公司)，克佛特(Kearfott)的 SKN602 惯性导航系统在内的 ETNA 导航／攻击系统，这套导航／攻击系统尚与汤姆森公司 VE120 抬头显示器、库札(Crouzet)97 导航显示器、武装管制仪表板／选择器、库札66 航空资料计算机、TRT 无线电高度仪、SFIM 三轴姿态指示器以及LMT TACAN(即战术空中导航)系统配合使用。然而法国航舰上的 TACAN 系统主要还是用来提供军旗IVM 机导航之用。超级军旗机因为 ETNA 系统的协助，在没有陆上固定地物可供修正参考的情况下，每飞行小时的误差度在 2.2 公里之内。
超军旗三面图