最初，法国空军只是把“阵风”B作为换装教练机而小批购买。当时法国人认为，航电的进步将能帮助“阵风”C飞行员执行所有作战任务。但是1991年的海湾战争证明了打击和侦察任务最好需要两人机组，所以法国空军增加了“阵风”B的购买数量。
“阵风”M与“阵风”C非常相似，目视可见的不同点就是换装了舰载型起落架，并增加了拦阻钩。“阵风”M的起落架非常粗壮，前起落架集成了弹射挂钩。较长的前起落架增加了“阵风”M的地面迎角以增加起飞性能。此外由于前起落架较长，M型取消了机腹中线前挂架。
“阵风”C/B也安装了跑道拦阻钩，只是和M型相比要轻型很多。“阵风”M必须采用足够强壮的拦阻钩，才能承受住飞机全油门勾住甲板拦阻索时的强大冲击力。
“阵风”M加强了机身结构以承受着舰时的冲击。该机还增加了内置电动登机梯、机载微波降落系统（使M型的着舰比之前的法国舰载机更容易）、一套可以从航母获得位置参考信息的“Telemir”惯性导航系统。“阵风”M的空重比C型增加了500千克，为了保持与家族其他型号间的通用性，M型没有折叠机翼。
尽管“阵风”项目的研制很顺利，但在政治方面就磕磕绊绊了。冷战的结束干扰了西方的所有新战斗机研制项目，无一例外地都被拖延了研制周期，削减了采购数量。1999年7月，第一架生产型“阵风”——一架海航的“阵风”M首飞，同一“阵风”M02原型机降落在了“戴高乐”号航母上。法国海航对“阵风”的需求比法国空军更迫切，因为当时海航的舰载战斗机还是老掉牙的F-8，而法国空军已经有了“幻影”2000。
2001年12月，“阵风”M开始交付，2002年夏天，海航的第一个“阵风”M中队在“戴高乐”号上形成作战能力。与欧洲战斗机一样，“阵风”也采用了分阶段升级的方式：
首批交付的“阵风”是F1标准，其具备空空作战能力，只安装了基本的航电套件。武器是内置机炮和“魔术”、“米卡”EM空空导弹。最初匆匆服役的几架“阵风”M被定义为LF1标准，任务计算机是老型号而不是MDPU，也没有安装机炮。这些LF1飞机现在已经升级到F1标准。
F2标准增加了打击能力，可以投射激光制导炸弹和“阿帕奇”/Scalp巡航导弹，RBE2雷达也增加了空面和地形跟踪飞行模式，机鼻安装了OSF传感器，增加了Link 16数据链。此外F2用“米卡”IR导弹取代了“魔术”，“阵风”还能挂载伙伴加油吊舱。
2009年达索开始交付F3标准的“阵风”，使该机真正具备了多用途作战能力。F3的RBE2雷达具备了计划中的全部模式，增加了发射AASM导弹的能力，可以用ASMP-A执行核打击任务。当然也能挂载“飞鱼”和ANF导弹执行反舰任务，用RECO NG吊舱执行侦察任务。F3标准还增加了DVI其他座舱增强功能，以及“矛隼”头盔瞄准具，并支持“罗孚”地空数据链系统，支持“伙伴”加油吊舱。所有F1和F2在大修时都会被升级到F3标准。
随后达索又制定了F3+标准，以改善“阵风”的多用途性能并加强该机的出口竞争力。F3+的一个重大改进是RBE2雷达有源电子扫描阵列（AESA）改进型。AESA可以被认为是一个射频阵列，阵列由发送/接收（T/R）模块组成，每个有模块都有自己的发射器和接收器电路。T/R模块在处理器的控制下一起操作，也可以通过程序操纵部分模块来执行特定功能，如部分模块作为雷达使用，而另一些模块作为干扰机使用。
2004年，泰雷兹公司被授予AESA系统的合同，同年秋天雷达样机开始装机试飞，2012年末第一台生产型RBE2-AA AESA雷达交付。F3+同样装备了先进的具有跟踪能力的IRST——OST-1F，以及增强型导弹告警接收机DDM-NG，还可以选装定向红外对抗（DIRCM）系统，比红外干扰弹更有效。2013年末第一架F3+交付法国空军评估。
泰雷兹公司正在为“阵风”研制“下一代激光瞄准吊舱”（PDL NG），用于取代“达摩克利斯”吊舱。同时，法国空军战斗机在阿富汗的作战表明需要小型制导弹药，如20千克滑翔制导炸弹或激光制导火箭弹。现有弹药不仅昂贵，而且在轰炸塔利班时威力过大，特别是在城市地区，较重的弹药可能会导致严重的“附带伤害”。
达索正在制定“阵风”F4标准，但还最终确定内容，并且也在考虑2025年之后的“阵风”中期升级计划。
法国海军的60架“阵风”在2012年交付完毕。尽管海航曾计划60架中的35架是“阵风”BM双座型，但在2004年底为了节约开支，“阵风”BM被取消。讽刺的是，节省下的这部分钱又因为“阵风”研发周期的拖延而不得不用于升级明显过时的机载设备上，以及用于未来阵风生产批次的研制。