B-2 Block 30 投掷 JDAM 炸弹
密苏里州怀特曼 AFB 的第 509 轰炸联队是首个接收 B-2 的联队。该联队在 1993 年 4 月 1 日重新组建来接收 B-2。第 509 联队的历史可追溯到第 509 混编大队，在二战中向日本投下了原子弹。第 509 联队之前在新罕布什尔州皮斯 AFB 操作 FB-111A，1988 年皮斯基地关闭时被解散。第 509 联队下辖第 393 轰炸中队和第 394 战斗训练中队。1993 年 12 月 17 日该联队接收首架 B-2，1995 年 1 月 24 日该联队的一架 B-2 参加了内利斯基地的“红旗”演习，投掷了两枚 Mk 84 炸弹，从此 B-2 定期参加“红旗”演习。1997 年 1 月 1 日美国空军宣布第 509 联队达到有限作战能力，可投掷常规武器。同年 4 月 1 日美国空军宣布第 509 联队可同时执行常规和核任务。1998 年 1 月 8 日第 325 轰炸联队并入第 509 联队。
第 509 轰炸联队徽章
1996 年 5 月 B-2 机队因其中一架飞机发现尾喷管固定件裂纹而停飞 8 天，期间检查了所有飞机的尾喷管固定件，出现问题的统统更换。1997 年 4 月因一架飞机在飞行中发动机传动轴破损而又一次停飞，调查发现传动轴总成壳体上有检测不到的裂纹，该机在 4 月中旬重返蓝天。
1999 年 3 月 24 日第 509 联队的两架 B-2A 参加了北约轰炸科索沃的“盟军”行动，B-2 从怀特曼 AFB 起飞后飞行 31 小时轰炸了科索沃的目标，这也是 GBU-29/30 JDAM 的首次实战。
B-2 的隐身涂层修复过程，涂料具有毒性。日常 B-2 的涂层维护工作相当繁琐
B-2 清单
82-1066/1071 B-2A Block 10（AV-1/AV-6，c/n 1001/1006）
1066”致命美女“，2000 年升级成 Block 30，现名”美国幽灵“。
1067”亚利桑那幽灵“，1997 年升级成 Block 30。
1068”Shady Lady“/”鬼魂“，1999 年升级成 Block 30，现名”纽约幽灵“。
1069”印第安纳幽灵“，2000 年升级成 Block 30。
1070”火与冰“，1999 年升级成 Block 30，现名”俄亥俄幽灵“。
1071”黑寡妇“，升级成 Block 30，现名”密西西比幽灵“。
88-0328/0332 B-2A Block 10（AV-7/AV-11，c/n 1007/1011）
0328”德克萨斯幽灵“，1998 年升级成 Block 30。
0329”密苏里幽灵“，1997 年升级成 Block 30。
0330”加利福尼亚幽灵“，1998 年升级成 Block 30。
0331”南卡罗来纳幽灵“，1998 年升级成 Block 30。
0332”华盛顿幽灵“，1999 年升级成 Block 30。
89-0127/0129 B-2A Block 10
0127 AV-12 c/n 1012”堪萨斯幽灵“，1996 年升级成 Block 20，1998 年升级成 Block 30。
0128 AV-13 c/n 1013”内布拉斯加幽灵”，1996 年升级成 Block 20，1999 年升级成 Block 30。
0129 AV-14 c/n 1014“佐治亚幽灵”，1997 年升级成 Block 20，1999 年升级成 Block 30。
90-0040/0041 B-2A Block 10
0040 AV-15 c/n 1015”阿拉斯加幽灵”，1997 年升级成 Block 20，1999 年升级成 Block 30。
0041 AV-16 c/n 1016“夏威夷幽灵”，1996 升级成 Block 20 1996，1999 年升级成 Block 30。
92-0700 B-2A Block 20
0700 AV-17 c/n 1017“佛罗里达幽灵” ，1999 年升级成 Block 30。
93-1085/1086 B-2A Block 20
1085 AV-18 c/n 1018“俄克拉荷马幽灵”，2000 年升级成 Block 30。
1086 AV-19 c/n 1019”基蒂霍克幽灵”，2000 年升级成 Block 30。
93-1087/1088 B-2A Block 30
1087 AV-20 c/n 1020“宾夕法尼亚幽灵”。
1088 AV-21 c/n 1021“路易斯安那幽灵”。
2008 年 2 月 23 日，B-2 89-0127”堪萨斯幽灵“因大气数据传感器进水汽，读取数据错误而在关岛安德森空军基地基地起飞时坠毁