在 1950 年代末，RB-45C 迅速被 RB-47E 取代，到了 1959 年代中期，只有 1 架 RB-45C 保留在空军财产目录上。
在龙卷风家族中还有用于武器装备研发的型号，其中 DB-45A 与 DB-45C 被用于制导武器指挥机。最后生产的一架 B-45A（47-096）被改装为发动机测试机，型号为 JB-45A（J 代表暂时测试状态），其弹舱经过改装以容纳测试发动机舱。飞机升空后，测试发动机降下以避开机身紊流，随后启动开始测试。这架飞机曾测试过威斯丁豪斯 J34 发动机。另外还有一架 B-45C（48-008）被改装用于普惠 J57 和 J75 喷气发动机的测试，型号为 JB-45C。除此之外，还有一架 RB-45C（48-017）被改装为 JRB-45C 发动机测试机。
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