在 1951~1952 年美军在太平洋进行的一系列大气层核试验中，B-45A 曾两次投下了为雷神导弹研制的 Mark 7 战斗部。
首架具备核攻击能力的 B-45A 于 1952 年 5 月抵达英国，到 6 月中旬全部 40 架“苦工”B-45 部署到位。7 月又有 15 架 B-45A 加入“苦工”计划，与前一批相比这些 B-45 安装了更先进的尾部防御系统，并且安装了前一批飞机未及安装的附加油箱燃油表，由于这批飞机在弹舱后部安装了一个 4,542 升的油箱，所以只能在弹舱前部挂载一枚特定型号的核弹。改装工作一直持续到 1954 年 3 月。4 个 B-45A 中队作为战略空军司令部的前线威慑力量在欧洲度过了 1950 年代最初的几年。
波音的新锐 B-47 开始服役后，B-45A 的性能已迅速显得过时了。1950 年代中期开始，B-45A 逐渐退出一线，到了 1958 年 1 月，现役 B-45A 已少于 50 架。驻英国第 47 轰炸机联队的 B-45A 被道格拉斯 B-66 破坏者代替，到了 1958 年 7 月，在英国的 B-45 都被转移到美军在欧洲和北非的其他基地，大部分飞机在当地废弃。
这张照片很好得展示了 B-45A 的前机身概况
一些装备艾利森引擎的早期 B-45A 被用于训练用途，型号改为 TB-45A，其中一些用于拖靶训练任务，在弹舱中安装了液压绞盘和索具，用以拖曳一架翼展 6m 的钱斯.沃特（Chance Vought）滑翔靶机。
B-45C
龙卷风的下一个生产型是 B-45C（NA-153），而不是 B-45B——预想中安装新型雷达和火控系统之后的型号。B-45C 两侧翼尖可以安装了一对 4,500 升可抛副油箱，另外使用加固型带框架的座舱盖取代了 A 型的气泡座舱盖。C 型炸弹舱内部左侧增加了一个单点式地面加油口。B-45C 还具备空中加油能力，在投弹舱和驾驶舱间增加了空中加油口。C 型使用 4 具 2,360kg 静态推力的 J47-GE-13/15 发动机，最大起飞重量从 A 型的 36,930kg 增加到了 49,000kg。
Wright-Patterson 空军基地保存的一架 B-45C，摄于 1974 年
第一架 B-45C 在 1949 年 5 月 3 日首飞，B-45C 的生产工作从 1947 年 9 月 22 日持续到 1950 年 4 月 13 日。空军本来计划装备规模巨大的 B-45C 机队，但在 10 架 B-45C 生产出后，就当即决定停止龙卷风的生产，转向投资 B-47 的一种放大型（B-52）。33 架仍在生产线上的 B-45C被改装成改照相绘图和侦察机，即 RB-45C。
一些 B-45A 也按照 C 型的标准进行升级以延长服役寿命并解决 A 型上一些恼人的可靠性问题。
火箭助推起飞的 B-45C
RB-45C
龙卷风家族的最后一个成员是 RB-45C。RB-45C（NA-153）取消了透明投弹舱，机头前端安装了一部前视照像机，致使整个机鼻形状看起来像鸭嘴。为了增加起飞推力，RB-45C 配备了发动机注水加力系统，在发动机舱下方吊挂 810 升的可抛水箱。在不用注水加力时，RB-45C 也可以通过助推火箭帮助起飞。
RB-45C 三面图
侦察型的机组也为 4 名——飞行员，副飞行员/无线电报员，尾炮手，照相员/领航员，其中照相员/领航员位置在无舷窗的机鼻中。
RB-45C 的机鼻中安装了 5 部照相机，4 部垂直向下拍摄，一部向前下方拍摄，其余照相机安装在弹舱之后的一个隔舱中。侦察型的弹舱在照相任务中可携带 25 个 M-122 闪光弹及一个附油箱，飞机总燃料容量是 30,783 升。
美国战略空军博物馆馆藏 RB-45C
照相员在飞行中可以转移至后照相舱，但一定要在非增压状况下从空的弹仓内穿过。
1950 年 4 月首架 RB-45C 试飞成功，6 月空军开始接收 RB-45C，其中多数装备给战略空军司令部，10 月全部 33 架 RB-45C 交付完毕。
RB-45C 曾参加了朝鲜战争。1950 年秋战术空军司令部 RB-45C 部署到远东，而此时战略空军司令部第 91 战略侦察中队的 RB-29 面临志愿军空军 MiG-15 战斗机的严重威胁，已无法实施侦察、目标指示和轰炸效果评估任务。于是第 91 中队接管了战术空军的 RB-45C 并开始在北朝鲜上空执行侦察任务。在头几个月，RB-45C 都能成功规避米格机，但在 1951 年 4 月 9 日一架 RB-45C 差点被米格机捕食，从此美国空军决定 RB-45 必须要有战机护航才能进入北朝鲜领空。1951 年 11 月 9 日，另一次类似事件导致 RB-45 即使在有护航的条件下也要限制白天进入北朝鲜领空。1952 年 1 月，第 91 中队奉命转为夜间侦察。一些 RB-45C 被涂成全黑色以便逃避探照灯的追踪。但 RB-45 并不擅长夜间照相，因为前弹舱舱门打开投掷闪光弹时飞机颠簸太严重。RB-45 不久就淡出朝鲜战场，结束了龙卷风的实战经历。
在朝鲜战争中，RB-45 飞行员发明了一种新的防御方法，将尾部两挺 12.7mm 机枪固向上 45 度或者向下 45 度开火，由飞行员通过开关控制，形成扫射扇面干扰敌机瞄准，样可以省去尾部机枪手。
RB-45C 也服役于驻欧洲第 19 战术侦察中队。英国皇家空军也装备过 RB-45C，这个秘密直到最近才被披露。英国空军机组在美国和英国斯科尔索普（Sculthorpe）接受训练，在 1950 年代中期实施了对苏联上领空的纵深穿透和侦察飞行。
1950 年，一架战略空军 RB-45C（48-012）实施了喷气式飞机的首次空中加油，加油机是 KB-29P。
1952 年 7 月 29 日，一架第 91 战略侦察联队的 RB-45C（48-042）从阿拉斯加艾尔门多夫（Elmendorf）空军基地起飞完成了跨太平洋不着陆飞行，最后抵达日本横田基地。飞行中沿途由 KB-29 进行了两次空中加油，这一壮举为机组赢取了 1952 年 Mackay 奖。