飞行中的 Me 323D
刚见到 Me 323 的非洲军团士兵都很惊奇它巨大的体形。但它蒙布的机身中弹易燃烧，使搭乘过的士兵对它评价不高。实际上 Me 323 构造结实，故障率低，还是比较可靠的运输机。
Me 323 的最大优点是生产工艺简单。开始制造时每架需 40,000 工时，后来降为 12,000 工时。而且在奥贝尔特拉夫堡工厂的工人大多还是陆军惩罚大队中的未熟练工。
Me 323 的产量 1943 年 1 月为 12 架，2 月达到 27 架。以后平均月产量降为 8.5 架。德军原打算把第 900 特战航空联队（KGrzbV900）改装为第 323 特战航空团的第 3 联队，但由于 Me 323 的供应不足而作罢。这个时期，生产的 Me 323 全部供给己组建的两个联队和东线的分遣中队。
Me 323 可在草场起降
从 1943 年 2 月 23 日起的 8 个星期中，第 1、第 2 联队向突尼斯比塞大进行 160 架次的运输飞行，因盟军战斗机扫射机场而损失不少。4 月 10 日混编在运输机队中的 3 架 Me 323D 在突尼斯北面被击坠，10 日和 16 日又有 3 架 Me 323D在盟军空袭特拉巴尼时被击毁。
打开机头货舱门的 Me 323
4 月 22 日，第 5 运输航空团（TG5，4 月初由 KGzbV323 改称）的第 1、第 2 联队出动全部可用的 16 架 Me 323D 向突尼斯空运燃料，它们依例混在 Ju 52 机群中。机群在邦角上空遭英军两中队“喷火”战斗机和南非空军 4 架 P-40 战斗机的袭击，14 架“巨人”被击落，140 名机组人员只有 19 人生还。两天后，又有一架 Me 323D 在突尼斯基地遭扫射，最后只剩一架“巨人”返回特拉巴尼。遭到毁灭性打击的第 5 运输航空团只好灰溜溜地撤回德国。这支部队在 1,200 架次出动中运输物资 15,000 吨。其中包括轻武器 324 吨，卡车 309 吨，口径 150 毫米以下的火炮 209 吨，装甲车 95 吨，防空与反坦克炮 83 吨，波尔图堡大型雷达器材 42 吨……。
笫 5 运输航空团的 Me 323E（1943 年，东线）
在地中海上空遭美军 B-26 拦击的 Me 323E-1
“巨人”的改型
德军吸收地中海战区的惨痛教训，又发展 Me 323 的武装强化型。原型第 13、14 号机在拉普汉姆改造，机头的机枪下移，左右两个视界良好的窗式枪座架设 MG131 重机枪各一挺，机身两侧也新设 MG131 机枪的窗式枪座，全机共装备 MG131 重机枪和 MG15 轻机枪各 4 挺。两机机身构造加固，燃油量增加。13 号机与 D 型一样装 6 台格罗姆-罗纳 14N 发动机；而 14 号机原准备改用 4 台起飞功率达 1,340 马力的尤莫 211F 液冷发动机，后还是因尤莫发动机难以到手而作罢。13 号机成为 E-1 型的原型。1943 年春，“巨人”的生产由齐柏林公司继续在主翼上面、外侧发动机后方增设两个装 20 毫米 MG151 机炮的 EDL151 泡型炮塔以代替背部枪塔的 Me 323 被称为 E-2 型。它们中的一架又改装为编队护航用的 E-2/WT 型，它的主翼上有 4 个 EDL151 炮塔，加上机头的旋转炮塔和机身侧的炮座，共装备 11 门 MG151 机炮和 4 挺 MG131 重机枪，乘员 17 名，全部炮座都用装甲防护，不再搭运货物。经过试飞，苯拙的 E-2/WT 型被认为远不如护航战斗机实用，被中止了发展。
Me 323E-2 的主翼骨架
Me 323E 头部的窗式枪座
1944 年春，德国全面中止运输机的生产，但“巨人”的发展还在拉普汉姆继续。1943 年底由原型 16 号机发展的 Me 323F 型开始试飞。它装用起飞功率 1,350 马力的尤莫 211R 发动机，最大起飞重量 58.1 吨，最大运载量 18.3 吨，其武装与 E-2 型一样，10 月 Me 323F-1 型的生产计划又被 G 型取代。原型 17 号机准备发展为装 6 台起飞功率 1,320 马力格罗姆-罗纳 14R 发动机的 G 型，当 G 型正在制造中，“巨人”的开发生产被全面中止。
飞行中的 Me 323E-2，注意其起落架布局
“巨人”还有许多试验计划，一架搭载 17.7 吨炸弹作投弹试验的“巨人”由 He 111Z 曳航离陆，但它尚未到达投弹高度飞机就失去操纵坠毁，乘员全部死亡。后来发现在几天前由于美军飞机的扫射，它的骨架己受到破坏。
齐柏林公司与法国 SNCOSO 公司合作发展 ZSO 523“超巨人”，“ZSO”就是两公司首字母的合成。它的翼展达 70 米，机长 40.25 米，全备机重超过 50 吨，，计划搭载 35 吨货物。动力为 6 台功率 2,100 马力的格罗姆-罗纳 14R 发动机，在 3,800 米高度的最大时速340千米，以时速 310 千米巡航的航程予定为 2,000 千米。在德军从巴黎溃逃时，ZSO 523 正处在制作同尺寸木制模型阶段。
ZSO 523 三面图
ZSO 523 模型
结局
1943 年 4 月底，从西西里撤回的第 5 运输航空团在奥贝尔特拉堡补充了飞机和人员，5 月在达姆上校指挥下重返地中海战区。在非洲军团溃灭后调往东线，团部设在华沙，部队分驻在保加利亚的凯斯敏特和罗马尼亚的福克沙尼，由第 4 航空军第 2 空运司令部指挥撤退德军。以数量不足的飞机应付里加—基洛夫格勒，加拉兹—塞瓦斯托波尔和布加勒斯特—奇里斯多夫地区的空运，一直到 1944 年 5 月巴尔干战线德军全面崩溃为止，共出动巨人 2,000 架次以上。此后随着第 5 运输航空团的撤消，“巨人”的活动也最后结束。