使用了明灰白色涂装的零式练习用战斗机，神池海军航空队所属机，1944年
零式舰战的标准色是饴色，饴色的由来有两种说法，一是由日本水饴的颜色淡化而成，二是由练习机的橘色透明化而成。而饴色涂装的用途，一般认为是防止腐蚀机体而在灰色涂装上覆盖一层饴色的表面保护涂装。
饴色
橙黄色（オレンジ）
在实际操作中，并不是所有的零战都会使用饴色涂装，零战使用的涂装有全面饴色、全面灰色、上面浓深绿色下面饴色、上面浓深绿色下面灰色和上面浓深绿色下面橙黄色五种。一般只有舰载机和水上飞机会优先进行表面保护涂装。
使用全面饴色涂装的二式水战，802空所属，1943年状态
使用全面明灰白色涂装的零战22型，岩国空所属
而轰炸机的涂装则与战斗机有着较明显的不同。陆上轰炸机一般使用上面迷彩，下面灰色的涂装；舰载轰炸机中在1940年前统一使用银色涂装，1940年后，舰载攻击机使用暗绿色/灰色混和涂装，舰载爆击机使用通体灰色涂装和浓深绿色/灰色混和涂装。
三菱灰，用于一式陆攻、九六式陆攻
灰色涂装一般用于迷彩涂装和混和涂装的下部
中岛灰，用于九七舰攻、天山和银河
爱知灰，用于九九舰爆、彗星和流星
与灰色系不同的是，严格意义上讲，褐色系（ブラウン系）并不能称为一个色系。因为茶褐色系只有两种颜色：土色（土色）和茶褐色（暗褐色）。与陆航大规模使用褐色不同，褐色系只是作为日本海航早期迷彩的一种配色，用于侵华战争和太平洋战争前期。
土色（土色）
九试陆上轰炸机丙方案，实验性采用了暗绿色/土色涂装
使用了土色与暗绿色混合的云型迷彩的96式2号2型舰战，12空所属机
茶褐色（暗褐色）
随着暗绿色/深墨绿色涂装的广泛使用，土色系也退出使用。
暗绿色系
第二航空战队航空母舰“飞龙”所属九七式舰攻，攻击机队中队长友永丈市座机，中途岛海战状态
暗绿色系（ダークグリーン系）是日本海航三大标准涂装色系中使用时间最长、使用范围最广、使用效果最好的涂装色系。在1937年到1945年，这一色系被广泛应用于日本海军的各个机种。暗绿色系包括暗绿色（緑黑色&暗緑色）、深墨绿色（濃緑黑色）和浅绿色（淡緑色）。
这一色系中最早登场的暗绿色（緑黑色）是作为迷彩的一部分使用的。抗日战争爆发后，海航的前线部队首先换装了暗绿色/茶褐色的云型迷彩涂装。
使用云型迷彩的第13航空队所属九六式舰战，1938年1月状态
1938年1月31日，联合舰队司令部发布命令，陆上攻击机和舰载攻击机统一使用暗绿色（緑黑色）/茶褐色（枯草色）迷彩涂装，这种涂装作为正式涂装被使用到1940年。
1940年，联合舰队司令部颁布了新修订的「連合艦隊飛行機識別規程」。在第一项规定：
当艦隊所屬飛行機ハ艦上戦闘機，艦上攻擊機，99式艦上爆擊機，12試3座水上偵察機及ビ10試水上觀測機ノ外ハ迷彩塗裝ヲ実施スルモノトス。
——「連合艦隊飛行機識別規程」（昭和15年11月15日）
这表示联合舰队所有舰战、舰攻、99式舰爆、12试舰侦（即零式水侦）和10试水观（即零式水观）之外的其他飞机使用迷彩涂装，而上述几类飞机则使用纯色涂装：
灰色/饴色涂装：零式舰战、99式舰爆、12试舰侦、10试水观；
暗绿色（暗緑色）/灰色&饴色涂装：97式舰攻、99式舰爆（极少数）
清漆（ワニス）涂装：96式舰战；
海军由此开始使用暗绿色系的纯色涂装。
97式舰攻，第一航空战队航空母舰“赤城”攻击机队渊田美津雄队长机，奇袭珍珠港状态
1941年11月到1942年2月，空技厂进行了针对飞机涂装色伪装效果的一系列实验，研究成果被记入《研究実驗成績報告•空技報0266》中的「飛行機塗色二関スル研究」中，参与对比的5中标准涂装色包括：明灰白色、明灰绿色、暗绿色、深墨绿色和浅绿色。最终认为深墨绿色（D1）伪装效果最好。联合舰队决定从1943年起，在所有作战飞机上实装深墨绿色/饴色涂装。
1943年，联合舰队发布临时标准117号（仮規格117），将深墨绿色同暗绿色合并为“深墨绿色（濃緑黑色）”，色号D2。由此，深墨绿色涂装成为战争后期广泛使用的涂装。
在实际操作中，由于没有具体的调色标准，导致各厂的深墨绿色/暗绿色也不统一。
三菱系暗绿色，主要用于三菱系飞机，如雷电、三菱制零式、烈风、一式陆攻等三菱制飞机
局地战斗机雷电21型，302空所属机
中岛制暗绿色，用于中岛制零战后期型
