2007 年 10 月，一架 F-2B 在一次试验飞行中起飞后坠毁，飞机在地面滑行后着火，2 名机组成员受伤。
2008 年 1 月 21 日，1 架 F-2 在日本三泽以东的海面上空的空对空训练中操纵杆手柄脱落，飞行员紧靠 5 厘米长的残余部分恢复飞机控制安全降落。事后 JASDF 停飞了整个 F-2 机队。
2011 年 3 月 11 日，日本本州岛附近海域发生里氏 8.9 级地震，震中位于宫城县以东太平洋海域，位于地震灾区宫城县松岛基地的 18 架 F-2B 被海水淹没。在遭受海啸袭击后，28 架战斗机全部进水，部分战斗机被冲撞到机库的墙壁上，受损十分严重，携带的导弹也丢落海啸中。这些 F-2B 隶属第 21 训练航空队。防卫厅先后完成其中六架战机的整修，但是发现维修费用比购买新战机还要贵，因此决定放弃对剩下的 12 架战机继续进行修理，准备解体处理。JASDF 将从被水淹过的机体上挑选可用零件，松岛重新制定 F-2 飞行员培训计划。
2011 年 9 月 27 日三菱重工结束了 F-2 的生产，并将最后一架战机交付防卫厅，一直负责该机生产的三菱重工小牧南工厂当天举行了纪念仪式。包括样原型机在内共三菱交付了 98 架 F-2。
JASDF 以下部队装备了 F-2：
•三泽基地：第 3 航空团 第 3 飞行队、第 8 飞行队 •筑城基地：第 8 航空团 第 6 飞行队 •松岛基地：第 4 航空团 第 21 飞行队 •岐阜基地：飞行开发实验团（XF-2） •浜松基地：第 1 术科学校（实习用教具）
2012 年 2 月底，日本防卫厅对外公布了一项 F-2 的升级计划，为该机装备 AAM-4B 型中距空空导弹，以及换装 J/APG-2 型雷达，整个升级计划预计耗资超过 36 亿美元。AAM-4B 导弹的研制工作开始于 2001 年，当时提出的目标是其射程要比已经服役的 AAM-4 导弹至少提高 20%，与美国的 AIM-120B+ 相当；导弹采用自主引导模式时，射程要超过上面两种导弹 40%。但是在后来的研制过程中，JASDF 提高了对新导弹的要求，三菱重工也趁机提出为该导弹装备有源相控阵雷达（AESA）导引头，这也使 AAM-4B 成为世界上第一种配备该型导引头的空空导弹。AAM-4B 导弹的 AESA 导引头采用日本国内研制的 T-R 模块，具有更远的探测距离和更高的灵敏度，导弹性能达到雷声公司最新的 AIM-120C-7 的水平。
三菱重工在研制 AAM-4B 的过程中，发现 J/APG-1 雷达无法发挥新导弹的全部作战潜力，因而提出建议为 F-2 换装新雷达。2004 年，日本政府批准了为 F-2 换装雷达的计划。
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——通用动力/洛克希德•马丁 F-16“战隼”轻型多用途战斗机
Armstrong
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F-2 超改
F-2 超改是洛马公司提出用于改进 F-2 的一整套计划方案，旨在提高 F-2 的综合作战能力，特别是远程对地攻击能力。F-2 超改最早在 2004 年 10 月初于日本横滨举行的“日本国际航空航天展”上展出。该机由三菱重工和洛马公司联合研制，技术性能以 Block 50/52 F-16 为标准。具体改进包括：采用新的火控软件；加装霍尼韦尔的 H423 激光陀螺导航系统以及 GPS 接收机；增加火控计算机内存容量；换装数据传输速度更快的新型调制解调器、新型多功能彩色显示器以及新一代 MIL-STD-1760 数据总线；采用先进的 AN/ALR-56M 雷达告警接收机；加装1 6 号数据链；采用新的飞行员夜视镜、新型头盔瞄准具、先进敌我识别系统、前视红外吊舱；机身背部加装与 Block 60 类似的保形油箱。
经过改进的 F-2 超改将增加发射 AIM-120C 中距空空导弹和 AIM-9X 矢量控制红外成像格斗导弹的能力。并能够使用包括“宝石路”系列激光制导炸弹、风偏修正弹药、日本防卫厅M、AGM-154A 联合防区外武器和 AGM-88 反辐射导弹等精确制导武器。
此外，F-2 超改还可加装 AN/AAQ-33 瞄准吊舱，进行夜间精确对地攻击。AN/AAQ-33 的性能比以前的 AN/AAQ-13/14 吊舱更先进，采用模块化设计，集成了高分辨率的第三代中波前视红外系统、双模式激光器、CCD、激光点跟踪器和激光标示器，大大提高了对远程目标的探测和识别能力。
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——通用动力/洛克希德•马丁 F-16“战隼”轻型多用途战斗机
Armstrong
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1984 年 GD 推出了“敏捷隼”概念，用于对抗苏联的新锐战机米格-29 和苏-27。该机使用了已在计划中的 MSIP IV 阶段改进项目的一些技术，此外机翼加大了 25%，并使用改进型的 GE F110-GE-129 或 PW F100-PW-229 发动机。但当时很少有客户对其感兴趣。
GD 不轻易放弃，又把“敏捷隼”作为 F-22 先进战术战斗机的低成本替代方案，推荐给美国空军和北约四个 F-16 伙伴国，GD 认为新的欧洲战斗机和达索的“阵风”以及萨博的“鹰狮”缺乏足以对抗米格-29/苏-27 的性能和航电。
1987 年 10 月 USAF 宣布即使欧洲伙伴不参加，也可能独自发展“敏捷隼”。但是随着苏联的解体，军费的削减，“敏捷隼”最终胎死腹中。从某种角度看，日本的 F-2 就是“敏捷隼”概念的复活。
F-16AT，“隼”21
F-16AT 或“隼”21 是 GD 在90年代提出的ATF低成本替代方案，该机沿用了 F-16XL 的基本设计，但换装了 ATF 的发动机。该机并没有沿用 XL 的曲线箭形翼，而是采用了梯形翼。洛马基于此概念向阿联酋提交了 F-16U 方案，但最后被否决。