到了 1988 年春天，阿富汗的局势没有发生太大的变化：克霍斯特仍处于包围中，但是抵抗运动也没有能力将它攻陷，苏军的轰炸在持续——并不频繁，但每一次都很猛烈，这样的情况一直持续到苏联人开始撤军为止。最先撤离的是驻扎在巴里考特地区的部队——于 1988 年 4 月 23 日——撤向贾拉拉巴德，苏联人希望撤军能够井然有序，在平静的环境中进行。但是事与愿违，圣战者开始向贾拉拉巴德发起一系列的猛攻，造成了重大的伤亡。5 月间，苏联人开始从阿富汗南部和西南部撤出部队，但不是直接撤走，撤出的部队有很大一部分投入到了贾济地区的新战斗中，在那里活跃着很大一支抵抗运动的部队。6 月 24 日，一小队抵抗运动的战士组织了一次完美的对喀布尔机场的袭击，摧毁了 8 架 苏-25，在接下来的几天里，巴格拉姆空军基地开始受到经常性的火箭袭击。尽管如此，苏联人还是展开了对喀布尔政权的大规模援助，在接下来的几个月里，数百吨的武器弹药和其他物资被空运到阿富汗，而且，从 1988 年 7 月下旬开始，苏联飞机开始了对巴基斯坦境内抵抗组织营地的新的袭击。其中的一次行动以灾难而告终。
1988 年 8 月 4 日下午，一队 苏-25 轰炸了米兰沙附近的一个抵抗运动营地。太阳落山前半小时，他们被发现，第 14 中队的两架 F-16A——驾驶员是阿瑟.伯克哈里中尉（他的飞机编号 85-725）和陶菲克.拉吉中尉——起飞拦截，到达汉古地区上空时，巴基斯坦飞行员被告知敌机转向飞回了阿富汗，于是 F-16 放慢速度，准备做数小时的晚间战斗巡逻，然而......伯克哈里中尉后来这样说道：“当我正要做 300 度的转弯时，地面控制员报告说在我左方 30 度发现目标，距离 15 海里。于是我向左转发现了目标，地面指挥官清楚地命令我一直向前飞并攻击。在 7 海里的高度，我用一枚红外追踪导弹锁定了目标。这时他向右转弯，一下子把我拉下了 3.5 海里。我打开加力，把我们之间的距离缩短了 2.5 海里。这时导弹的“最佳发射距离”指示灯开始闪烁，各种参数也符合，于是我发射了导弹，在显示屏的瞄准框里看着它朝目标飞去，片刻后就在瞄准框里看到了一个火球。我把飞机向左拉了 120 度，下降了 5,000 英尺的高度以躲开碎片和火焰。这时我回头一看，发现 8 点钟方向有一团闪光，距离 3-4 海里，‘是导弹！’我的心跳都要停止了，然而地面指挥官向我保证说在附近没有其他的飞机。此后我就安全地回家了。”
阿瑟.伯克哈里中尉
根据苏联方面的消息，在遭到 F-16 攻击时，苏-25 编队的长机，亚历山大.鲁兹柯伊上校做了一个难度很大的 6.5G 转弯进行规避，然而显然鲁兹柯伊上校没有观察到在漆黑的天空中，他的对手在他后面做了一个难度更大的转弯，发射了 AIM-9L 并击落了他。被击中的 苏-25 断成了两截，残骸在第二天早晨被发现，但座舱是空的，因此巴基斯坦组织了一个搜索队，第二天晚上鲁兹柯伊被当地人俘虏后交给了当局。有趣的是，这个苏联飞行员坚持认为他是被一枚来自前方的由雷达制导的导弹击落的，他拒绝相信伯克哈里中尉仅仅是用了一枚 AIM-9L，而且是从后方击中了他。然而，有一个问题还没有搞清楚，那就是为什么在遭到 F-16 截击以后苏联飞机编队还坚持轰炸预定目标，这些目标并不值得他们冒这么大的风险，而且他们的地面指挥系统应该对他们发出警告。考虑到这样一个事实：当鲁兹柯伊上校被击落时，剩下的三架飞机距阿富汗边界还很远，也许上校试图与 F-16 周旋以争取一些时间让他的伙伴逃走。对苏联人来说，鲁兹柯伊上校和他的 苏-25 被击落并不是当月全部的坏消息，四天以后，一名阿富汗飞行员驾驶他的 米格-21 叛逃到了巴基斯坦的帕拉其那。此外，鲁兹柯伊编队的战术运用——或者说是防御动作表现得很不清楚，这一点同样体现在一个月后发生的另一次空战中。
1988 年 9 月 12 日晨 6：06，第 14 中队的两架 F-16A 战斗机从卡马拉空军基地起飞执行在纳瓦卡伊地区上空的战斗巡航任务，它们的驾驶员是卡里德.穆罕默德（飞机编号 85-728）和安瓦尔.侯赛因。6：40 左右，地面指挥通知说在东方有两个高空目标正在接近巴领空，引导他们前去拦截。F-16 编队很快到达了指定空域，但这时两个目标转向往北沿着边界线飞行。其实，当天敌机的数量不止两架，而是第 120 航空团的 12 架 米格-23MLD，其中 8 架满载炸弹准备轰炸库纳尔山谷的目标，另外 4 架分为两个小组——瑟吉.布林中校和戈烈申科少校一组，佩特科夫少校和丹臣科夫上尉一组——为他们护航。此时除了先前的两个目标以外，地面雷达又发现了另外四个目标，于是他们迅速指挥 F-16 去截击这些新的威胁，而穆罕默德上尉的雷达发现了总共 6 架敌机，他前面的 4 架组成一个编队，另外 2 架在他的后方。现在巴基斯坦人面临的问题是：他们飞机的高度只有 3,500 米，而敌机的高度在 10,000 米以上，而且他们后方敌人双机编队的速度比前方的四机编队速度快得多。实际上，苏军的地面雷达已然发现了 F-16 并命令佩特科夫和丹臣科夫拦截他们，另外 4 架向西返航。但是，巴基斯坦飞机的速度更快，在 12 千米的距离上，穆罕默德的雷达成功锁定一架敌机，然而由于苏联飞行员使用了红外干扰装置，F-16 的“响尾蛇”导弹却没能锁定该目标。穆罕默德又作了三次锁定目标的努力，但都失败了，在与目标的距离减少到 3 千米以内时，他第四次尝试锁定敌机，这次终于成功了，以低至高/左至右模式，135 度方向角，穆罕默德发射了一枚 AIM-9L。他的目标——由瑟吉.普里瓦洛夫上校驾驶的编号为“金刚钻 55”的 米格-23MLD 开动了红外干扰器，“响尾蛇”在他的上方爆炸，数十片炽热的导弹碎片击中了 米格 机的机翼和机身。苏联战斗机编队开始转向西飞行，普里瓦洛夫的飞机带伤，佩特科夫和丹臣科夫也跟了上来加入了编队，他们似乎并未试图使用他们的 R-24 来对付 F-16，而从北方飞过来的布林和戈烈申科则曾尝试这样做。穆罕默德在敌机编队下方做了一个大幅度的左转弯，迅速咬住了敌机编队的队尾，他现在处于极佳的攻击位置，前方有至少有 6 架 米格-23MLD！F-16 的雷达立即锁定了一架敌机，但穆罕默德放弃了这个锁定而将武器系统调节为“自动锁定”方式，武器系统自动选择了 AIM-9P 导弹，这种导弹从后方攻击目标的性能良好。在 3 千米的距离，巴基斯坦人向佩特科夫少校的 米格-23MLD 发射了导弹，这时地面指挥警告他说有两架苏联战斗机在他的正后方！穆罕默德立即转身面对这个巨大的威胁，但他什么也没发现，而当他再向西转回来试图追击苏联战机编队的时候，敌机已经飞远了，于是两架 F-16 返回了基地。