几内亚比绍（葡属几内亚）
在葡萄牙在非洲的殖民地中，几内亚比绍是最贫瘠，也是人口最少的一个。但是由于其战略地理位置的缘故，在葡萄牙的非洲殖民地体系中，几内亚比绍具有相当的重要性。1879 年，葡萄牙当局把几内亚比绍从佛得角划出，建立殖民政府，并将其视为连接安哥拉和莫桑比克与葡萄牙本土的枢纽。几内亚比绍的领土面积较小，全境被几条河流分割开来，对葡萄牙不利的是，几内亚比绍的周边都是非洲民族主义非常盛行的国家，这个地区的人民对欧洲国家的殖民政策抱有非常强烈的反感。1956 年，阿米尔卡.卡布拉尔组织成立了几内亚比绍和佛得角独立党（以下简称几佛独立党），1959 年，该党在比绍组织了一次停工，葡萄牙警察对停工进行了镇压，在混乱中开枪打死了 50 人，打死 100 人。象当时其他的非洲殖民地一样，几内亚比绍缺少一个政治上成熟的政党，几佛独立党虽然从名字上看很正式，但是在政治活动中的表现还很幼稚。即便如此，由于里斯本一贯以来只顾从非洲攫取各种天然资源，而只是在最低限度上予非洲人民以回报，贫苦已久的几内亚比绍人民终于不再忍耐，因停工引起的骚乱最终演变成一次彻底的起义。
佛得角独立党党徽
几内亚比绍独立战争正式开始于 1961 年 8 月，几乎在同时，在安哥拉也爆发了民族独立战争。葡萄牙因此开始调动军队，其空军也派兵增援比绍的比萨兰卡空军基地，以加强原本驻扎在那里的 T-6“德克萨斯人”教练攻击机中队。最先卷入战争的葡萄牙空军部队是第 52 分遣队，该部队装备了八架 F-86F“佩刀”战斗机，原本驻扎在葡萄牙国内的蒙特利尔空军基地。将 F-86F 战斗机从葡萄牙国内运送到几内亚比绍的行动代号为“阿特拉斯行动”，第 52 分遣队的主要作战任务是为葡萄牙陆军提供近距空中火力支援。
1963 年 1 月 23 日，由几佛独立党领导的一支游击队袭击了几内亚比绍南部蒂特市、布巴市、卡拉昆达市的殖民军警察局，打响了争取民族解放武装斗争的第一枪。当时，葡萄牙军队在几内亚比绍仅仅驻有两个连的部队，而且其空军第 52 分遣队的 F-86F“佩刀”战斗机和 T-6“德克萨斯人”教练攻击机正忙于在莫桑比克和安哥拉的战斗，因此在应对几佛独立党游击队的攻击时相当吃力。实际上，根据后来解密的资料看，葡萄牙政府从一开始就已经明白她将输掉这场战争。因为除了国际政治的大势所趋以外，从军事上看，几佛独立党游击队是一支组织严密的军队，其骨干成员在阿尔及利亚、古巴和苏联接受训练，主要的后方基地设在塞内加尔。几佛独立党游击队主要采取小部队作战的方式，机动性强并且非常灵活，具有很大的弹性。游击队员的主要装备是各种型号的卡宾枪、苏制 AK-47 步枪、意大利产布雷达 6.5mm 轻机枪、美制汤普森冲锋枪。到了战争的中后期，游击队的轻武器火力得到了提升，他们得到了古巴提供的火箭筒、82 毫米迫击炮以及无后坐力步枪。游击队员们一般随身携带自己的武器弹药以及补给品，但是，随着战事的白热化，游击队对后勤运输的需要愈发强烈起来，为了应对越来越大的后勤压力，几佛独立党游击队甚至建立起了自己的海军力量，其基地设在几内亚共和国境内。面对着游击队咄咄逼人的攻势，葡萄牙殖民军队疲于应付，但是他们不敢撤退，因为葡萄牙人害怕在几内亚比绍的军事失败会在各个殖民地引起连锁反应。
葡萄牙空军的 F-86F
1964 年初，几佛独立党游击队解放了科莫岛，葡萄牙殖民军迅速展开反扑，但这并不管用，即便其空军的 F-86F“佩刀”战斗机从比绍起飞赶来助战对这次战斗的结局也没有丝毫影响。经此战以后，葡萄牙在几内亚比绍的军事行动能力渐渐萎缩，只能在各个据点的堡垒内据守，而无法对游击队发起反击；只能将殖民官员转移到安全区域内以保卫他们的人身安全，而无法控制广大人民，更不用说切断人民与游击队的联系了。从一开始，葡萄牙殖民军就没有打胜这场战争的希望。
然而葡萄牙人却并不甘心就此失败，他们仍在积极筹划反攻，目标当然是科莫岛。这是一个庞大且复杂的计划，代号“三叉戟行动”，是一次葡萄牙陆海空三军联合作战。战斗的过程很激烈，但葡萄牙殖民军队的进展却很缓慢，由于战斗、疾病以及营养不良，很多葡萄牙殖民军士兵在这个西非的小岛上受尽煎熬，最后慢慢死去。经过长达 71 天的激烈战斗，付出惨重代价的葡萄牙殖民军终于重新占领了这个岛屿。值得一提的是，在“三叉戟行动”中，葡萄牙空军总共出动了包括 F-86F“佩刀”战斗机和 T-6“德克萨斯人”教练攻击机在内的各种作战飞机总计 851 次，以支援地面部队的战斗。
但是仅仅只过了两个月，几佛独立党游击队就重新夺回了科莫岛上的阵地，这是因为葡萄牙殖民军还要在别的地方对付游击队，无法把主要兵力集中部署在科莫岛上的缘故。几佛独立党游击队在几内亚南部建立了新的根据地，特别是在康坦赫兹和奎塔芬半岛的根据地，对驻扎在卡迪奥和贝丹达的葡萄牙殖民军形成了合围之势，葡萄牙殖民军急忙调动兵力解围，几内亚比绍独立战争的焦点转移到了这里，科莫岛因此失去了战略上的重要意义。
葡萄牙在殖民地战争中使用的“云雀 III”直升机
在焦头烂额地应对游击队攻势的同时，葡萄牙政府还有另外一个更让他们头疼的问题。原来美国人觉得葡萄牙空军把 F-86F“佩刀”战斗机部署在非洲并将其用于与游击队作战感到不满，认为这样做削弱了北约在欧洲大西洋沿岸地区的防卫力量。因此在 1964 年 10 月，葡萄牙空军被迫将全部 16 架 F-86F“佩刀”战斗机撤回国内。有意思的是，华盛顿抱怨葡萄牙在几内亚比绍部署 F-86F 战斗机，但是却对葡萄牙空军部署在安哥拉的 F-84G 战斗轰炸机却不闻不问，其原因很有可能是因为 F-86F 可以用于防空拦截作战，而 F-84G 主要用于对地攻击作战。