F-4E试射“信使”-1激光制导炸弹
“风筝”-2000集束弹药布撒器
在“科萨”1-3项目中，TFB.3的两架F-4E在1988-1990年间进行了伙伴加油改装，在机腹中线挂载了比奇Model 1080空中加油舱，并在机翼内侧挂架上挂上了两个额外副油箱，同时还有一架RF-4E安装了固定空中加油探头并进行了测试。但上述项目到最后几乎都被取消，不是遭遇无法克服的技术问题就是伊朗空军高层取消了需求。
F-4E对F-14A进行伙伴加油
在巴基斯坦的援助下，伊朗空军在1994年大修了100架AIM-9J导弹，其中包括TFB.3基地的20枚，但“响尾蛇”的数量仍然不足，为此TFB.3开始尝试把中国制造的PL-7C红外制导空空导弹改装到F-4E上，没有获得成功。之后基地又开始尝试给“鬼怪”集成俄罗斯的R-73E空空导弹，最后在2002年获得成功，F-4E 3-6556发射一枚R-73E击落了一架无人靶机。
2008年，伊朗飞机工业公司（IACI）从伊朗空军获得了一份合同，对64架F-4E和部分F-4D实施延寿和升级，项目被命名为“杜兰”，分三阶段进行。在“杜兰”项目中，大部分之前被终止的F-4升级项目都得到了恢复。
F-4E“杜兰”能够挂载的精确制导弹药
TFB.3的第31战术训练中队是第一个接收“杜兰”升级的F-4E中队，因为该中队是伊朗“鬼怪”的第一大用户。第一架完成“杜兰”升级的F-4E是3-6556，之前曾参与了R-73E改装项目。该机的延寿和升级从2009年1月一直持续到2011年8月14日，飞机装上了新型无线电，并更换了伊朗自行制造操纵翼面。完成升级的飞机重新加入了第31中队。
F-4E 3-6556是第一架完成“杜兰”升级的飞机
两年后，F-4E 3-6675率先安装了可收放加油探头，同时还进行了重新布线，能发射C-801K、C-802A、C-803和C-704KD巡航和反舰导弹，该机最后被移交给第32中队。2015年7月13日，F-4E 3-6675首次试射C-704KD导弹，获得成功后，伊朗空军命令伊朗航空工业组织开始制造100枚该弹的国产型——“胜利”导弹。2016年2月9日，第一批“胜利”导弹交付伊朗空军。
为了兼容锥套式空中加油系统，F-4E 3-6675率先安装了可收放加油探头
挂载“胜利”导弹的伊朗F-4E
测试中的“胜利”导弹
“鬼怪”的大修
在2009-2012年期间，伊朗航空工业组织每年最多只能延寿和升级两架“杜兰”F-4，远无法满足空军的需要。于是伊朗工业研究与自给自足圣战部开始在梅赫拉巴德大修厂对F-4E展开大修，目标是把飞机恢复到完全任务能力（FMC）状态。
大修中的伊朗F-4
第32中队的几架F-4E经过梅赫拉巴德的定期基地级大修（PDM）后恢复到完全任务能力状态，甚至还进行了有限升级。其中第一架是F-4E 3-6598，该机在2009年因发动机起火而烧坏机身。该机在大修中更换上了梅赫拉巴德“顶点”工业综合体制造的后机身面板，2012年2月18日，该机在修复后进行了首次功能检查试飞，几周后重新交付第32中队。
经大修后归队的F-4E 3-6598
第二架是F-4E 3-6650，于2011年3月15日抵达梅赫拉巴德接收定期基地级大修，期间还为TLS-99激光瞄准吊舱进行了布线。该机在2013年5月返回第32中队。
