F-35 如果能利用 EOTS 光电传感器或 EODAS 光电分布孔径传感器系统为 AIM-9X 提供中继制导，那将会解决 AIM-9X 在武器舱内的制导问题
F-35 可能需要在空战格斗中早早打开武器舱门的另一个原因是导弹锁定。导弹可以先锁定后发射，这样确保导弹可靠跟踪目标；也可以先发射后锁定，这样可以及早发射，或者在舱门打开的瞬间就尽快发射，缩短舱门开启的时间。中程空空导弹采用先发射后锁定没有问题，导弹飞行的时间长，离轴角度小，反正也需要中途弹道修正，这相当于先发射后锁定。近程空空导弹在理论上也可以先发射后锁定，但近程空空导弹瞄准的离轴角度大，目标变化快，先发射后锁定一有可靠锁定的困难，二在发射到锁定这段时间里，导弹可能已经做了很多无用功，浪费了宝贵的初始能量，还错失了占位。及早打开武器舱门，使导弹的导引头从发射到命中全程锁定，可以大大提高命中的可靠性，但这样做要大大增加阻力，影响 F-35 本来就不算优秀的机动性。
F-35 可以挂载的空空导弹总数并不少，但机内武器舱的搭配不能按照任务随意调整，翼下挂载不仅破坏隐身，还增加阻力，使本来就动力不足的 F-35 更加累赘。相比之下，第三代战斗机不隐身，但可以根据任务需要灵活改变挂载的空空导弹组合，像 F-15 最多可以一次挂载 4 枚 AIM-9X 近程空空导弹。F-35A 装备了机内航炮，F-35B 和 C 为了控制空重，连机内航炮也取消了，如果有空战需要，可以挂载外挂的隐身航炮吊舱。如果外挂可以隐身的话，F-35 也不用费那个事，追求机内武器舱了，外挂还增加气动阻力。
F-35A 是唯一安装内置机炮的型号
关于 F-35 空战性能的比较，应该注意的是和美国的第三代或者 3.5 代战斗机比较，否则容易鸡同鸭比。尤其应该避免用 F-35 的武器或者电子系统的优越性作为比较的基础，这不是 F-35 独有的优越性，而是美国军工体系的优越性，美国的第三代或者 3.5 代战斗机同样可以得益。有意思的是，波音和通用电气在 JSF 及其发动机的竞标落选后，悄悄发力，有可能对 F-35 悄悄使坏。增强隐身的 F-18E“国际型”除了在航电方面采用最新技术外，还采用保形油箱增加航程，并使用隐形外挂武器吊舱，降低翼下挂架的雷达反射特征和气动阻力。外挂武器吊舱在隐身上依然无法和机内武器舱相提并论，但两者在隐身上的差距上大大缩小了。通用电气则把被盖茨枪毙的 F136 发动机的技术用到 F414 发动机上，使 F414EPE（Enhanced Performance Engine，意为增强性能发动机）的推力提高差不多 20%，使 F414 的推重比接近 11：1，和 F135 相当。这样一来，F-18E 的推重比达到 1.12，和 F-15C 相当，超音速加速时间减半，油耗有所降低，有望一举甩掉“超级塑料虫”的坏名声，并大大拉开和 F-35 的性能差距。波音和通用电气都刻意避免和 F-35 的直接比较，毕竟 F-35 尽管身陷囹圄，但依旧是五角大楼的重点项目，正面挑战是政治上高度不正确的事情。但对于正在选择下一代战斗机的盟国来说，F-18E 和 F-35 之间的优劣就不那么一目了然了，尤其当 F-35 的裸机单价达到 F-18E 两倍的情况下。
现有 F414 发动机也可以升级成 F414EPE
据说所有 F-35 的负面新闻里，有 50% 是波音为了多卖超级虫子而制造的